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[資源]
表型組相關(guān)
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隨著二代測序技術(shù)的發(fā)展，在育種群體中獲取標(biāo)記數(shù)據(jù)的成本在不斷降低，這有利于研究人員更好的定位與某些表型相關(guān)的數(shù)量性狀位點(diǎn)，然而，對相關(guān)表型的QTL進(jìn)行準(zhǔn)確的定位需要高質(zhì)量的表型數(shù)據(jù)。 第一本書主要講述了如何獲取表型組學(xué)數(shù)據(jù)。 1.Phenomics How Next-Generation Phenotyping is Revolutionizing Plant Breeding。 第二本書主要講述了利用R軟件對形態(tài)進(jìn)行分析，這可以適用于葉形態(tài)，魚形態(tài)的分析，利用獲得的形態(tài)數(shù)據(jù)可以完成數(shù)量性狀位點(diǎn)的定位。 2.Morphometrics with R。 如果大家對形態(tài)的數(shù)量性狀位點(diǎn)定位感興趣可以聯(lián)系我。 |
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- 附件 2 : Morphometrics_with_R_(use_R).pdf
- 附件 3 : Shape_mapping:_genetic_mapping_meetsgeometric_morphometrics.pdf
2015-04-02 14:49:54, 5.95 M
2015-04-02 14:50:12, 4.08 M
2015-04-02 14:51:22, 457.49 K
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2樓2015-04-02 16:32:22
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你好，我簡單談以下我所接觸的實(shí)驗(yàn)，不過不是大田實(shí)驗(yàn)都是室內(nèi)實(shí)驗(yàn)。1. 某植物幼苗根生長形態(tài)測定，這里我們利用成像系統(tǒng) 獲得了一個群體根在不同時間段的2D或者3D 形態(tài)，利用形態(tài)分析技術(shù)對這些圖像處理，獲得一些關(guān)鍵數(shù)據(jù)（作為表型）能夠刻畫根的形態(tài)。2. 使用表型組學(xué)平臺，對某一雜交群體的不同生長階段43個表型進(jìn)行了測定。對于大田實(shí)驗(yàn)，我不清楚，不過書中第六章有介紹，不過我聽過有人用核磁共振對大田玉米的根結(jié)構(gòu)進(jìn)行掃描。 我覺得對一些表型可以直接進(jìn)行測量，可能誤差也不太大，但一些表型例如葉形態(tài)，根形態(tài)等 利用圖像處理技術(shù)可以更準(zhǔn)確的量化。在就是目前的表型組平臺，但不適合大田。 |
4樓2015-04-03 12:44:21
lonerice
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5樓2015-04-03 16:23:01
簡單回復(fù)
315692183樓
2015-04-03 11:19
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何枝可依6樓
2015-07-11 08:15
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