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崔永霞鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
如何進(jìn)行蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)分析 已有1人參與
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| 我手里有一個(gè)氨基酸序列，想做一下蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)分析，但是不知道從何下手。請(qǐng)各位高手指點(diǎn)。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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kx444555: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2015-04-09 08:23:40
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| 對(duì)這方面不了解的話，可以SWISS-MODEL 在線建模（http://swissmodel.expasy.org/），然后根據(jù)它選擇的模板的結(jié)構(gòu)對(duì)建模結(jié)果進(jìn)行分析；也可以自己用MODELER、Discovery Studio等軟件自己建模，然后分析。 |
2樓2015-04-09 08:11:59
崔永霞
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你好，我根據(jù)你給的網(wǎng)址做了在線建模分析，但是結(jié)果出來(lái)了，我看不懂啊 。http://swissmodel.expasy.org/interactive/B3r5Du/models/，能不能麻煩你再幫我看一下啊。謝謝了。 |
3樓2015-04-13 23:59:55
崔永霞
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4樓2015-04-14 00:01:08
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模板和你的序列同源性高達(dá)85%，建模結(jié)果是比較可靠的。 具體怎么看，告訴你方法：你先看選擇的模板，然后從PDB數(shù)據(jù)庫(kù)中找到該模板和對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn)，再?gòu)脑撐墨I(xiàn)入手分析自己的結(jié)構(gòu)。比如第一個(gè)結(jié)果，模板是2XZ1，對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn)如下： Remote control of regioselectivity in acyl-acyl carrier protein-desaturases. Guy, J.E., Whittle, E., Moche, M., Lengqvist, J., Lindqvist, Y., Shanklin, J. Journal: (2011) Proc.Natl.Acad.Sci.USA 108: 16594 PubMed: 21930947 PubMedCentral: PMC3189045 DOI: 10.1073/pnas.1110221108 |
5樓2015-04-14 08:24:11
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6樓2015-04-15 04:03:15
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7樓2015-04-15 04:37:38
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8樓2015-04-15 08:18:31
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9樓2015-04-15 22:21:09
10樓2018-01-13 11:50:36
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