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[交流] Dmol3如何實現(xiàn)真空層在計算后不改變

利用Dmol3計算二維結(jié)構(gòu)如石墨烯,真空層（即c值）剛開始設(shè)18A，計算后變小了。有人說的dmol3不支持固定坐標，可怎么做才能保證真空層不變。是計算完再把真空層調(diào)回初始值嗎（網(wǎng)友指點這樣做，但我懷疑）。

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1樓 2015-05-07 17:19:01

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yuanlh: 金幣+2, 謝謝回復�？墒俏蚁雰�(yōu)化結(jié)構(gòu)。catep計算太慢了，試著用demol3做，首先優(yōu)化二維平面結(jié)構(gòu)，然后在做吸附。 2015-05-11 14:33:18

把Geom Opt的More中的Opt cell去掉，這樣Lattice Vector始終不變。

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2樓2015-05-07 17:21:31

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石墨烯如果要弛豫結(jié)構(gòu)的話要么對石墨進行晶格的優(yōu)化，或者直接對石墨烯做不同晶格常數(shù)后用拋物線插值得到最佳晶格常數(shù)。

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3樓2015-05-11 15:36:23

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3樓: Originally posted by 卡開發(fā)發(fā) at 2015-05-11 15:36:23
石墨烯如果要弛豫結(jié)構(gòu)的話要么對石墨進行晶格的優(yōu)化，或者直接對石墨烯做不同晶格常數(shù)后用拋物線插值得到最佳晶格常數(shù)。

非常感謝你的關(guān)注，謝謝�。�！

但對于“或者直接對石墨烯做不同晶格常數(shù)后用拋物線插值得到最佳晶格常數(shù)”我不太明白。
我沒有優(yōu)化石墨結(jié)構(gòu)，是利用網(wǎng)上大家說的方法得到石墨烯原胞，然后擴大到3*3超胞，在這個結(jié)構(gòu)中刪除一些原子得到有缺陷的石墨烯（我主要研究這個結(jié)構(gòu)），對于這個結(jié)構(gòu)才開始優(yōu)化，然后在這個優(yōu)化結(jié)構(gòu)好的結(jié)構(gòu)上做吸附。我這樣做是否是錯的。

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4樓2015-05-11 18:15:04

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4樓: Originally posted by yuanlh at 2015-05-11 18:15:04
非常感謝你的關(guān)注，謝謝�。�！

但對于“或者直接對石墨烯做不同晶格常數(shù)后用拋物線插值得到最佳晶格常數(shù)”我不太明白。
我沒有優(yōu)化石墨結(jié)構(gòu)，是利用網(wǎng)上大家說的方法得到石墨烯原胞，然后擴大到3*3超胞，在 ...

石墨烯如果用slab模型描述的話除了c方向應(yīng)當固定，a與b方向相等，你可以做一組數(shù)，如a和b同時±0.5的范圍都做一次不opt cell的計算，體系的能量原則上在這個范圍上存在一個能量最低點，這個最低點可以通過將不同a,b與能量擬合拋物線得到。

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5樓2015-05-11 21:08:09

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我用Castep做，沒優(yōu)化石墨結(jié)構(gòu)，刪除一層后，改變C值；建立3*3超胞；刪除一些碳原子，固定C值；幾何優(yōu)化（opti cell 勾選）；結(jié)果得到       a = 7.493753       alpha = 90.000000
                                             b = 7.494083       beta  = 90.000000
                                             c = 18.000000       gamma =  119.987592
我再試試如優(yōu)化石墨結(jié)構(gòu)，看結(jié)果是否差別很大。

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6樓2015-05-12 14:33:46

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6樓: Originally posted by yuanlh at 2015-05-12 14:33:46
我用Castep做，沒優(yōu)化石墨結(jié)構(gòu)，刪除一層后，改變C值；建立3*3超胞；刪除一些碳原子，固定C值；幾何優(yōu)化（opti cell 勾選）；結(jié)果得到 a = 7.493753 alpha = 90.000000
...

這樣不行，如果用Optcell的方法做的話，石墨的結(jié)構(gòu)只能先優(yōu)化，之后再刪層。

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7樓2015-05-12 18:14:14

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！請問專家，我如利用183P6MM空間群建立結(jié)構(gòu)，再添加原子（0.333,0.667,0.5），得到晶胞，再建立超胞，得到所需要的結(jié)構(gòu)然后利用OptiCell再優(yōu)化結(jié)構(gòu)是否可行。

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8樓2015-05-14 09:45:06

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8樓: Originally posted by yuanlh at 2015-05-14 09:45:06

單胞建立完成就可以優(yōu)化晶格了，為啥要建成超胞再去優(yōu)化？

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9樓2016-08-12 10:48:46

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