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aflymoon金蟲 (小有名氣)
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[求助]
特殊位置氧原子加氫怎么處理 已有1人參與
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遇到一個晶體結(jié)構(gòu) 中心氧原子的占有率是1/6，要加氫成OH，無法在殘余峰中找到氫原子 如果hadd理論加氫，grow之后會跑出六個占有率為1/6的氫原子，非�；靵y 請問哪位大俠有這方面加氫的經(jīng)驗(yàn)，萬分感激！ |
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
aflymoon: 金幣+25, ★★★很有幫助, 謝謝啦，我試一試！ 2015-05-11 20:47:36
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aflymoon: 金幣+25, ★★★很有幫助, 謝謝啦，我試一試！ 2015-05-11 20:47:36
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本人初學(xué)結(jié)構(gòu)解析，幾點(diǎn)心得體會，與鈞分享如下： 1，無法在殘余峰中找到氫原子，似乎這不太可能，往往角度和距離不合理罷了，用DFIX限制下OH和HA-HB的距離，一般能解決問題。 2，占有率無序的原子加氫，個人覺得最靠譜的方法就是通過wingx找到理論氫的原子坐標(biāo)（個人覺得，不管用什么方法加氫，其實(shí)就是找氫理想的原子坐標(biāo)），然后修改熱振動參數(shù)，令人滿意的是，通過Cal-OH計算得到的氫原子坐標(biāo)，往往合理，不報AB類錯誤。當(dāng)然，任何一種方法沒有絕對的萬能，有些氫用此種方法是找不到理論坐標(biāo)的。 3，還可用Xseed理論加氫，通常此類方法加氫，鍵長要長些。 上面是我的一點(diǎn)心得體會，很多為什么，本人也不是很清楚，望各位高手雅正，我也可進(jìn)步，謝謝。  |
2樓2015-05-08 09:35:14
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