 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 2509 | 回復(fù): 10 | ||
Y224365木蟲 (小有名氣)
|
[求助]
Coarse-grain構(gòu)型搭建 已有3人參與
|
|
| 最近看到有使用VMD進(jìn)行把全原子模型轉(zhuǎn)化為CG模型的，想問一下就步驟是什么？還有l(wèi)ammps自帶的VOTCA主頁進(jìn)不去是怎么回事。哪位大神能夠總結(jié)一下lammps粗�；慕２襟E呢？求指教。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
293求調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
0703化學(xué)336分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
環(huán)境領(lǐng)域全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料專碩306英一數(shù)二
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
301求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
302求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
26博士申請(qǐng)
已經(jīng)有3人回復(fù)
chuntao118
新蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 93 (初中生)
- 金幣: 2590.9
- 散金: 1402
- 紅花: 25
- 帖子: 1611
- 在線: 241.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 1791567
- 注冊(cè): 2012-05-02
- 專業(yè): 計(jì)算數(shù)學(xué)與科學(xué)工程計(jì)算
2樓2015-05-13 13:54:27
whl_nick
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 3.5
- 帖子: 7
- 在線: 4.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 1760161
- 注冊(cè): 2012-04-17
- 專業(yè): 金屬基復(fù)合材料
|
nick@nick-B85M-D3V:~/lmp/lammps/examples/shear$ mpirun –np 4 ./lmp_serial<in.shear [proxy:0:0@nick-B85M-D3V] HYDU_create_process (./utils/launch/launch.c:75): execvp error on file –np (No such file or directory) =================================================================================== = BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES = EXIT CODE: 255 = CLEANING UP REMAINING PROCESSES = YOU CAN IGNORE THE BELOW CLEANUP MESSAGES =================================================================================== 像這樣的問題怎么解決？ |
3樓2015-05-13 17:18:54
Y224365
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 2612.1
- 帖子: 118
- 在線: 63.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 2474028
- 注冊(cè): 2013-05-21
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
4樓2015-05-14 17:01:55
Y224365
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 2612.1
- 帖子: 118
- 在線: 63.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 2474028
- 注冊(cè): 2013-05-21
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
5樓2015-05-14 20:31:59
Ergon
金蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 1332.5
- 散金: 220
- 紅花: 5
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 1553
- 在線: 105.5小時(shí)
- 蟲號(hào): 3295777
- 注冊(cè): 2014-06-27
- 性別: GG
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
|
樓主，不知道你做的體系是什么，我見大部分都是做是生物分子。我想做的是納米材料。 我最近也在做粗粒化模擬，打算用lammps來做，現(xiàn)在主要是建模和勢函數(shù)問題上卡著，還有就是不熟悉lammps。 建模我打算用的是全原子替代粗粒子。 勢函數(shù)估計(jì)得看文獻(xiàn)，不過還沒弄到勢函數(shù)上去。 我對(duì)lammps也就是剛?cè)腴T的級(jí)別，對(duì)于要求的性質(zhì)和相關(guān)的lammps命令不太懂，本來打算用lj勢簡單做做的�？墒且�(jì)算相關(guān)性質(zhì)時(shí)傻了眼，也不知道算什么，和用什么命令 （但是我猜想對(duì)于熟悉lammps和分子動(dòng)力學(xué)模擬的高手來說這個(gè)應(yīng)該是個(gè)小問題）還請(qǐng)樓主多多指點(diǎn)。 |
6樓2015-05-14 23:17:54
Y224365
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 2612.1
- 帖子: 118
- 在線: 63.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 2474028
- 注冊(cè): 2013-05-21
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
7樓2015-05-18 09:37:03
136zhangpong
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 53.1
- 帖子: 93
- 在線: 28.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 2745147
- 注冊(cè): 2013-10-19
- 專業(yè): 計(jì)算數(shù)學(xué)與科學(xué)工程計(jì)算
8樓2015-08-24 14:01:58
alundilong
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 129 (高中生)
- 金幣: 2019.1
- 紅花: 18
- 帖子: 309
- 在線: 56小時(shí)
- 蟲號(hào): 595468
- 注冊(cè): 2008-09-08
- 性別: GG
- 專業(yè): 傳熱傳質(zhì)學(xué)
9樓2015-08-24 22:39:21
chuntao118
新蟲 (著名寫手)
- 應(yīng)助: 93 (初中生)
- 金幣: 2590.9
- 散金: 1402
- 紅花: 25
- 帖子: 1611
- 在線: 241.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 1791567
- 注冊(cè): 2012-05-02
- 專業(yè): 計(jì)算數(shù)學(xué)與科學(xué)工程計(jì)算
10樓2015-08-27 12:42:01
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 Y224365 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿天津大學(xué)化學(xué)工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +7 | yangfz 2026-03-17 | 7/350 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 本人考085602 化學(xué)工程 專碩 +16 | 不知道叫什么！ 2026-03-15 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 梁成偉老師課題組歡迎你的加入 +8 | 一鴨鴨喲 2026-03-14 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 0854可跨調(diào)劑，一作一項(xiàng)核心論文五項(xiàng)專利，省、國級(jí)證書40+數(shù)一英一287 +3 | 小李0854 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 26申博 +4 | 八旬速覽 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +4 | 太陽花天天開心 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料專碩274一志愿陜西師范大學(xué)求調(diào)劑 +5 | 薛云鵬 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 327求調(diào)劑 +6 | 拾光任染 2026-03-15 | 11/550 |
|
|
|
[考博] 東華理工大學(xué)化材專業(yè)26屆碩士博士申請(qǐng) +6 | zlingli 2026-03-13 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑 +3 | Zys010410@ 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 材料工程327求調(diào)劑 +3 | xiaohe12w 2026-03-11 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +4 | 這么名字咋樣 2026-03-14 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大材料324分求調(diào)劑 +5 | 閆旭東 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +5 | 是Lupa啊 2026-03-11 | 5/250 |
|
|
|
[考研] ［0860］321分求調(diào)劑，ab區(qū)皆可 +4 | 寶貴熱 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +5 | 超級(jí)伊昂大王 2026-03-12 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿211化學(xué)學(xué)碩310分求調(diào)劑 +8 | 努力奮斗112 2026-03-12 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 程雨杭 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856化學(xué)工程280分求調(diào)劑 +4 | shenzxsn 2026-03-11 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑（食品/專碩） +3 | xc321 2026-03-12 | 6/300 |
|