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coldxzs鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
lammps碳納米管拉伸in文件報錯求助 急
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錯誤提示: domain too large for neighbor bin 還有一個問題之前用的一個deform的fix之后，用vmd顯示是一直拉長的，而沒有拉斷，是不是我還少了點什么？求大神幫忙！  PS：碳的lj勢函數(shù)參數(shù)是epsilon sigma是0.4396 和0.03851嗎？如果不是，是什么？ in文件如下 #------------------INITIALIZATION------------------ units lj dimension 3 atom_style atomic boundary s s p #------------------AYOM DEFINITION------------------ read_data data.txt #------------------FORCE FIELD------------------ #------------------potentials------------------ pair_style lj/cut 30 pair_coeff * * 0.4396 0.03851 neighbor 0.1 bin neigh_modify delay 5 check yes #------------------initial velocities------------- region 1 block INF INF INF INF INF 3 group lower region 1 region 2 block INF INF INF INF 17 INF group upper region 2 group boundary union lower upper group mobile subtract all boundary velocity lower set 0.0 0.0 0.0 #設(shè)置left區(qū)域原子初速度為0 velocity upper set 0.0 0.0 0.3 #設(shè)置right區(qū)域z方向原子速度為0.3 velocity mobile ramp vz 0.0 0.3 z 3 17 sum yes thermo_style multi thermo 50 min_style sd #能量最小模式 minimize 1.0e-6 1.0e-6 1000 10000 #馳豫 fix 1 lower setforce 0.0 NULL NULL #固定下邊的原子 thermo 200 #每200步輸出一次結(jié)果 timestep 0.003 #時間步長0.003ps run 5000 #運(yùn)行5000步 timestep 1.0 fix 3 all nve fix 4 all temp/rescale 300 1.0 1.0 5 1.0 fix 5 all deform 1000 z erate 0.002 units box #設(shè)置沿z方向拉伸，應(yīng)變率為0.002(1/ps) dump 1 all atom 232 dump.lammmpstrj min_style sd minimize 1.0e-6 1.0e-6 1000 10000 run 100000 本人小本科生，剛接觸lammps,求大神解答！ |
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2樓2018-07-26 10:36:40
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