 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 4043 | 回復(fù): 5 | |||
Mayerss新蟲 (小有名氣)
|
[求助]
關(guān)于Green-Kubo方法模擬水的粘度 已有3人參與
|
|
求問有沒有大神用lammps做過水的模擬？ 我現(xiàn)在改編了一下manual里面計(jì)算液氬粘度的那個(gè)算例，來模擬水的粘度，300k下得到的結(jié)果是0.2mPa.s，查得的標(biāo)準(zhǔn)值是0.8mPa.s，請(qǐng)路過的大神幫忙看一下是哪里出了問題，多謝！ in文件貼在下面，data文件和log文件在附件中。 # LAMMPS input script for viscosity of purewater units real variable T equal 300 variable V equal vol variable dt equal 0.4 variable p equal 400 # correlation length variable s equal 5 # sample interval variable d equal $p*$s # dump interval # convert from LAMMPS real units to SI variable kB equal 1.3806504e-23 # [J/K/ Boltzmann variable atm2Pa equal 101325.0 variable A2m equal 1.0e-10 variable fs2s equal 1.0e-15 variable convert equal ${atm2Pa}*${atm2Pa}*${fs2s}*${A2m}*${A2m}*${A2m} # setup problem dimension 3 boundary p p p atom_style full bond_style harmonic angle_style harmonic pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.125 12 15 kspace_style pppm/tip4p 1e-6 read_data sketch.data pair_coeff 1 2 0.0 0.0 # O-H pair_coeff 2 2 0.0 0.0 # H-H pair_coeff 1 1 0.16275 3.16435 # O-O timestep ${dt} thermo $d # equilibration and thermalization velocity all create $T 102486 mom yes rot yes dist gaussian fix NVT all nvt temp $T $T 40 drag 0.2 run 100000 # viscosity calculation, switch to NVE if desired #unfix NVT #fix NVE all nve reset_timestep 0 variable pxy equal pxy variable pxz equal pxz variable pyz equal pyz fix SS all ave/correlate $s $p $d & v_pxy v_pxz v_pyz type auto file S0St.dat ave running variable scale equal ${convert}/(${kB}*$T)*$V*$s*${dt} variable v11 equal trap(f_SS[3])*${scale} variable v22 equal trap(f_SS[4])*${scale} variable v33 equal trap(f_SS[5])*${scale} thermo_style custom step temp press v_pxy v_pxz v_pyz v_v11 v_v22 v_v33 run 200000 variable v equal (v_v11+v_v22+v_v33)/3.0 variable ndens equal count(all)/vol print "average viscosity: $v [Pa.s/ @ $T K, ${ndens} /A^3" |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺(tái)，不對(duì)該內(nèi)容負(fù)責(zé)。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識(shí)產(chǎn)權(quán)問題，其責(zé)任在于用戶本人，如對(duì)版權(quán)有異議，請(qǐng)聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : log.lammps
- 附件 2 : sketch.data
2015-05-23 19:35:01, 21.42 K
2015-05-23 19:35:02, 361.88 K
» 猜你喜歡
321求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿中海洋材料工程專碩330分求調(diào)劑
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
一志愿天大材料與化工（085600）總分338
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
288求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
材料080500調(diào)劑求收留
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
294求調(diào)劑材料與化工專碩
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿985，本科211，0817化學(xué)工程與技術(shù)319求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
一志愿西安交通大學(xué)材料工程專業(yè) 282分求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
332求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 25°水蒸氣粘度
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 液體粘度的計(jì)算
已經(jīng)有14人回復(fù)
- Green一Kubo公式的應(yīng)用
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 1stopt能進(jìn)行隱函數(shù)非線性擬合嗎？誰能幫擬合一下新型液體的粘度混合計(jì)算公式
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 各位大俠請(qǐng)問用fluent仿真液固兩相流時(shí)固相的粘度需要設(shè)置嗎?
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 湍流粘度的意義
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 計(jì)算精度不高，且出現(xiàn)湍流粘度限制怎么辦
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 海水的動(dòng)力粘度u是多少？哪位大俠知道，，，十分感謝
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 請(qǐng)問：剪切粘度（shear viscosity）和容積粘度（bulk viscosity）的區(qū)別
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 【資源】關(guān)于圓管內(nèi)氣體流場(chǎng)中雷諾數(shù)與氣流速度及動(dòng)力粘度的問題
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【討論】Green-Kubo公式是基于第一性原理的嗎？ ？
已經(jīng)有4人回復(fù)
kakaxicheng
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 26.3
- 帖子: 20
- 在線: 45.8小時(shí)
- 蟲號(hào): 3523181
- 注冊(cè): 2014-11-06
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
2樓2016-10-04 15:58:53
brucefan
專家顧問 (著名寫手)
-
專家經(jīng)驗(yàn): +218 - 模擬EPI: 4
- 應(yīng)助: 422 (碩士)
- 金幣: 2294.8
- 散金: 1720
- 紅花: 88
- 帖子: 1423
- 在線: 670.2小時(shí)
- 蟲號(hào): 3048965
- 注冊(cè): 2014-03-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
- 管轄: 分子模擬
3樓2016-10-05 01:10:05
kakaxicheng
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 26.3
- 帖子: 20
- 在線: 45.8小時(shí)
- 蟲號(hào): 3523181
- 注冊(cè): 2014-11-06
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結(jié)構(gòu)、力學(xué)和
4樓2016-10-25 09:56:35
xu_jiangxin
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 8
- 帖子: 2
- 在線: 7小時(shí)
- 蟲號(hào): 5583966
- 注冊(cè): 2017-02-15
- 專業(yè): 熱物性與熱物理測(cè)試技術(shù)
【答案】應(yīng)助回帖
|
一樓的同學(xué)說不用轉(zhuǎn)化為SI ，這個(gè)我保留意見。我在自己的模擬中使用了單位轉(zhuǎn)化。關(guān)于你的data文件和in文件我說一下我的看法：你使用的是tip4p模型，卻使用了很多的spce模型的參數(shù)而不是tip4p模型的參數(shù)。 這是我自己的模擬結(jié)果：（300K,1.29E+5mol/m3） spce tip4p tip4p2005 0.567 0.420 0.721 使用的參數(shù)為lammps手冊(cè)“6.8 TIP4P water mode”中給出的參數(shù)，l |
5樓2017-08-28 09:13:22
SDXM
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 120.5
- 帖子: 5
- 在線: 34.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 2453408
- 注冊(cè): 2013-05-07
- 性別: GG
- 專業(yè): 制造系統(tǒng)與自動(dòng)化
|
你好，方便把您的data文件和input文件給我傳一份嗎？我也在做這個(gè)模擬，數(shù)據(jù)都來在6.8 TIP4P water mode，但是最終的結(jié)果卻對(duì)不上，謝謝您啦 我的郵箱是 1178408727@qq.com 非常感謝 |
6樓2018-03-14 04:04:02
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 Mayerss 的主題更新
| 6 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿武理材料305分求調(diào)劑 +5 | 想上岸的鯉魚 2026-03-18 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 085601專碩，總分342求調(diào)劑，地區(qū)不限 +5 | share_joy 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑，一志愿華南理工大學(xué)071005 +4 | ioodiiij 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | △小透明* 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
[考博] 環(huán)境領(lǐng)域全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室招收博士1-2名 +3 | QGZDSYS 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)336分求調(diào)劑 +6 | zbzihdhd 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +3 | 梁梁校校 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] 被我言中：新模板不強(qiáng)調(diào)格式了，假專家開始管格式了 +4 | beefly 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +7 | 好運(yùn)連綿不絕 2026-03-12 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 考研化學(xué)學(xué)碩調(diào)劑，一志愿985 +4 | 張vvvv 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料專碩326求調(diào)劑 +6 | 墨煜姒莘 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 本人考085602 化學(xué)工程 專碩 +16 | 不知道叫什么！ 2026-03-15 | 18/900 |
|
|
|
[考研] 材料與化工專碩調(diào)劑 +5 | heming3743 2026-03-16 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 275求調(diào)劑 +4 | 太陽花天天開心 2026-03-16 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 東南大學(xué)364求調(diào)劑 +5 | JasonYuiui 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大材料324分求調(diào)劑 +5 | 閆旭東 2026-03-14 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +4 | 學(xué)海漂泊 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 程雨杭 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +3 | ADT 2026-03-13 | 3/150 |
|