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majunjie3612金蟲 (正式寫手)
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[求助]
關(guān)于shchrodinger的配體準備和glide對接問題
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| 大家好，本人現(xiàn)在正在用shchrodinger的glide做對接練習，由于是剛開始接觸，想請大家解答幾個問題：1.我的配體分子和受體對接不上，monitor的States顯示completed：died，原文獻上是可以對接上的。2.我自己優(yōu)化完的配體和原文獻上的配體不一樣，我是使用LigPre準備的。3.請問constarins的positional和hydrophobic應(yīng)該怎么去定義，是不是我對接不上的原因和constains有關(guān)。請大家?guī)兔獯�。萬分感激！ |
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