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majunjie3612金蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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[求助]
關(guān)于shchrodinger的配體準(zhǔn)備和glide對(duì)接問(wèn)題
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| 大家好，本人現(xiàn)在正在用shchrodinger的glide做對(duì)接練習(xí)，由于是剛開(kāi)始接觸，想請(qǐng)大家解答幾個(gè)問(wèn)題：1.我的配體分子和受體對(duì)接不上，monitor的States顯示completed：died，原文獻(xiàn)上是可以對(duì)接上的。2.我自己優(yōu)化完的配體和原文獻(xiàn)上的配體不一樣，我是使用LigPre準(zhǔn)備的。3.請(qǐng)問(wèn)constarins的positional和hydrophobic應(yīng)該怎么去定義，是不是我對(duì)接不上的原因和constains有關(guān)。請(qǐng)大家?guī)兔獯�。萬(wàn)分感激！ |
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