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我L小狼新蟲 (初入文壇)
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[交流]
想請(qǐng)問(wèn)一下DH5α和K-12之間的關(guān)系 已有3人參與
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新手自己做微生物 想請(qǐng)教一下我們一般用的DH5α是K-12菌株改造過(guò)來(lái)嗎？它的Genome和我在NCBI上搜索的K-12的Genome有什么不同嗎？我可不可以直接用NCBI上的序列對(duì)DH5α的細(xì)菌做菌落PCR？謝謝咯 |
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RuyangHan
金蟲 (小有名氣)
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還是應(yīng)該在GenBank比對(duì)一下，看看你的目的基因是否缺失或引物結(jié)合位點(diǎn)是否匹配。以上兩點(diǎn)確認(rèn)后，菌落PCR應(yīng)該沒(méi)問(wèn)題。 K12是野生菌株。 DH5α的遺傳型 F- λ– endA1 glnV44 thi-1 recA1 relA1 gyrA96 deoR nupG Φ80dlacZΔM15 Δ(lacZYA-argF)U169, hsdR17(rK- mK+) 菌株遺傳性狀查詢可通過(guò)下列網(wǎng)站： http://cgsc.biology.yale.edu/ |
2樓2015-06-13 12:27:45
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... 首先， 是K-12而非K12， 后者是表面多糖的一種鑒別方式， 有著本質(zhì)上的區(qū)別 K-12應(yīng)該是在上個(gè)世紀(jì)40年Tatum開始用來(lái)做基因?qū)W研究才開始收到廣泛使用的，菌株由斯丹佛大學(xué)的科研人員管理， 中間有過(guò)菌株混謠的問(wèn)題。 最原始的， 由1922年分離的菌株早已經(jīng)不知道什么時(shí)候就丟失了， MG1655被認(rèn)為是離原始菌株最相近的菌株。 所有從原始的K-12變化出來(lái)的菌株都是K-12, 包括MG1655， DH5alpha, DH10beta, MC4100, W3110等， 或可多達(dá)上百種常用菌。 我念博士的實(shí)驗(yàn)室就有多達(dá)9000株菌， 其中6000株嚴(yán)格來(lái)講都可以算是K-12. |
3樓2015-06-14 13:30:27
602059625
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the DH5α genome is not publicly available 其他k12的基因組（MG1655、W3110）可作參考，一些內(nèi)切酶、重組酶、轉(zhuǎn)座子什么的可能會(huì)有不同 Highly accurate genome sequences of Escherichia coli K-12 strains MG1655 and W3110 Laboratory strains of Escherichia col：model citizens or deceitful delinquents growing old disgracefully Lineage: strain 1100 (Hoffman-Berling) --> MM294 (Meselson) --> DH1 (Hanahan) --> DH5 (Hanahan). Douglas Hanahan , personal communication Endonuclease I-deficient and ribonuclease I-deficient Escherichia coli mutants w208.PNG Pedigrees of some mutant strains of Escherichia coli K-12 http://openwetware.org/wiki/E._coli_genotypes#DH1 |
4樓2015-06-14 16:08:19
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