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[交流]
質(zhì)粒上定點突變不用DpnI酶消化的后果
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本人在已構(gòu)建成功的重組質(zhì)粒上定點突變,但沒有使用消化酶,直接轉(zhuǎn)化,有轉(zhuǎn)化子,提質(zhì)粒,測序,卻發(fā)現(xiàn)在設(shè)計好的位點沒有發(fā)生突變,想交流一下,是否跟消化酶有關(guān),想知道整個詳細的PCR過程和轉(zhuǎn)化后在質(zhì)粒模板和PCR產(chǎn)物在宿主菌中復制克隆的效率。謝謝啦~~~![]() ![]() ![]() |
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這是有的啊,模板質(zhì)粒帶有甲基化(質(zhì)粒需從dam,dcm非缺陷型的大腸桿菌菌株中提取,比如DH5a),PCR產(chǎn)生的DNA鏈不帶甲基化,DpnI的一個特性就是要其識別位點被甲基化后其才能切割DNA,這樣就把環(huán)狀DNA鏈和新和成的PCR產(chǎn)物鏈給區(qū)分開了,其只降解質(zhì)粒DNA鏈,不降解PCR產(chǎn)物鏈,經(jīng)過轉(zhuǎn)化,PCR產(chǎn)物鏈經(jīng)過修復形成環(huán)狀,從而完成突變 |
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體內(nèi)降解:原始質(zhì)粒模板可以被能降解甲基化質(zhì)粒的大腸桿菌(DMT)降解, 而去甲基化擴增產(chǎn)物不會被降解。 體外降解:甲基化模板可被Dpn1識別、切割,而去甲基化擴增產(chǎn)物不會被降解。 篩選依據(jù):來自大腸桿菌的質(zhì)粒99%發(fā)生甲基化;PCR產(chǎn)物是去甲基化的產(chǎn)物。 問題是:PCR產(chǎn)物在體內(nèi)甲基化之后不會被DMT降解嗎??還有原始質(zhì)粒就是甲基化的啊 在體內(nèi)不會被降解嗎?其實是一個問題,搞不懂。!還有,什么是DMT? |
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