 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 21396 | 回復(fù): 123 | ||||||||||||||||||||||
| 【獎勵】 本帖被評價77次，作者小范范1989增加金幣 61.4 個 | ||||||||||||||||||||||
| 當前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||||||||||||||||||||||
[資源]
高斯做紫外吸光譜和熒光光譜的方法（不一定準確哈） 已有6人參與
|
||||||||||||||||||||||
|
紫外吸收光譜和熒光光譜的做法（-我是這樣的，不一定準確，嘿嘿。） 一：紫外吸收光譜： 1：首先，需要用高斯來優(yōu)化基態(tài)的分子，就是普通的opt，我感覺高斯的用戶都應(yīng)該會，這事最簡單的一個，假如說優(yōu)化之后得到的文件為1.log（或者1.out）。 2：我們把1.log再次拖到高斯view中，再次保存成高斯輸入文件 2.gif。這時候，我們需要利用2.gjf來算的是基于基態(tài)結(jié)構(gòu)做的td文件，所以表頭應(yīng)該這樣寫：#p b3lyp/6-31g* td（nstates=20）當然這不一定準確，需要我們按照我們自己的要求進行修改，比如說我們的計算有溶劑，有溫度，有壓強，再比如有贗勢等等，這個需要自己再修改計算的表頭。假如說計算完之后，輸出的文件為2.log。那么在2.log里面我們會發(fā)現(xiàn)如下的輸出： Excitation energies and oscillator strengths: Excited State 1: Triplet-A 2.8450 eV 435.79 nm f=0.0000 <S**2>=2.000 209 -> 214 -0.13220 This state for optimization and/or second-order correction. Total Energy, E(TD-HF/TD-KS) = -2576.44057633 Copying the excited state density for this state as the 1-particle RhoCI density. Excited State 2: Triplet-A 2.8546 eV 434.33 nm f=0.0000 <S**2>=2.000 206 -> 214 0.10372 Excited State 3: Singlet-A 2.9106 eV 425.98 nm f=0.0269 <S**2>=0.000 212 -> 214 0.47207 213 -> 214 0.52044 Excited State 4: Singlet-A 2.9298 eV 423.19 nm f=0.0350 <S**2>=0.000 212 -> 214 0.51804 213 -> 214 -0.47391 Excited State 5: Triplet-A 3.0767 eV 402.98 nm f=0.0000 <S**2>=2.000 206 -> 215 0.22081 206 -> 216 -0.26880 206 -> 217 0.20657 Excited State 6: Triplet-A 3.0886 eV 401.42 nm f=0.0000 <S**2>=2.000 等等，一般在文件的4/5之處就能找到。 我計算的是td 50-50 所以說會有triplet的出現(xiàn)，這個沒事的。 3：有了2.log文件，我們可以把文件放到高斯view中，通過results—uv-vis看到紫外吸收光譜 4：如果更近一步的話，可以在做出了紫外吸收光譜圖之上，把鼠標放到我們高斯view看的圖像上的橫坐標上，右鍵—save data 保存數(shù)據(jù)，通過origin做出圖像。 （我一般采取這樣的方式） Ps：順帶說明一下，如果你采用的是第四部，那么保存出來的數(shù)據(jù)不是很多，可能需要我們把數(shù)據(jù)進行補充，需要用到一個展寬程序，程序很簡單，一看就懂，就是修改一下里面的初始波長，以及展寬等等。附件就是f90程序。 二：熒光光譜 1：熒光光譜需要的高斯計算文件就是優(yōu)化激發(fā)態(tài)的文件。其實如果對這個發(fā)光過程不太明白的話，可以先試試高斯手冊上自帶的熒光計算的粒子，但是，那個粒子里面考慮了溶劑的平衡效應(yīng)和非平衡效應(yīng)，如果我們要仔細研究的話，確實應(yīng)該是按照熒光手冊上的那七部來。 但是我這計算沒有考慮那么多。再就是熒光大部分都是從S1發(fā)出的，當然不排除高激發(fā)態(tài)的熒光，我這也是只說從s1發(fā)出的熒光。需要的高斯文件就是優(yōu)化s1的文件，#p b3lyp/6-31g* opt td 或者是opt td（singlet，root=1，nstates=20）等等，也是根據(jù)具體的情況我們在調(diào)劑，我感覺，優(yōu)化激發(fā)態(tài)很容易出錯，經(jīng)常出現(xiàn) you need sovle more …..等等，以及scf還有幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化的不收斂等等，調(diào)節(jié)的方式，別人已經(jīng)有總結(jié)了，我上研二上學期的時候，優(yōu)化四個算是比較大的分子，一直出現(xiàn)這個錯誤，我啥事也沒干，半年的時間就解決這個問題了，試了好多方式，最終解決了。 再就是，我還感覺一個問題就是，這個表頭寫的越簡單，越不容易出錯，就先只寫 opt td。 假如說優(yōu)化激發(fā)態(tài)的文件為1.gjf，計算輸出的文件為1.log 2：通過1.log我們會看到如下的輸出。 我的默認是3個，也就是沒寫nstates，如果想計算更多，可以寫上nsates=n。對了，寫到這里，我還突然想起來了，就是這個默認的三個，和增加nstates的時候，計算的輸出竟然不一樣，我當時也是很不理解，我在找個帖子問過。 http://ccc.keinsci.com/forum.php ... 1014&extra= 很感激sob大神的回復(fù)指點，現(xiàn)在好多人都去了他的論壇交流，而且，盧老師人很好，去上過他的課，一個優(yōu)點靦腆的大牛，很熱心，對你的問題一定會有解決的辦法。 Excited State 1: Singlet-A 2.7329 eV 453.68 nm f=0.0401 <S**2>=0.000 209 -> 214 -0.13558 213 -> 214 0.68419 This state for optimization and/or second-order correction. Total Energy, E(TD-HF/TD-KS) = -2573.61424900 Copying the excited state density for this state as the 1-particle RhoCI density. Excited State 2: Singlet-A 3.1823 eV 389.60 nm f=0.0872 <S**2>=0.000 206 -> 214 0.19196 207 -> 214 0.13463 Excited State 3: Singlet-A 3.5119 eV 353.04 nm f=0.0210 <S**2>=0.000 208 -> 214 0.24089 3：通過以上的計算文件，我們可以看到第一個excited就是我們要的熒光的波長。當然，你也可以把1.log，通過高斯view保存成2.gjf，然后在算個td得到 2.log，里面對應(yīng)的第一個的波長是一樣的。 4：如果想得到熒光光譜怎么辦？ 我當時看帖子，在sob的回復(fù)中看到了這樣的回復(fù)，我就保存下來了。如下圖。 3：我在重復(fù)一下sob老師的意思，我感覺就是把s1的振子強度保留，其余的都改為0.然后通過高斯view打開log文件，通過result—uv-vis看光譜，（和前面的吸收光譜一樣）。當然也可以保存數(shù)據(jù)，通過展寬程序在進行處理，和前面說的一樣。這就不贅述了。 上面就是做uv-vis和熒光光譜的方法。 如果說，保存了數(shù)據(jù)，通origin作圖，會遇到把吸收和發(fā)射的光譜放到一個圖像里面的問題，很多文章人家都這樣做，我當時是這樣處理的。這多虧了我張師姐和宋師姐，兩位師姐告訴了我。其實自己也能鼓搗出來，但是有師姐問問，快。哈哈哈 在這里我就不寫了，我當時學會了之后單獨自己總結(jié)了一個word，吸收圖像和發(fā)射圖像的畫法word，在附件中有，我們可以一起討論一下。 順帶推薦幾個我感覺比較好的帖子， http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7985639 yjcmwgk大神寫的一個程序，能分析td文件，很方便。 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1742565&fpage=1 還是yjcmwgk大神的文章 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1514220&fpage=1 還是大神的文章。 我水平比較低，通過在小木蟲和計算化學公社得到了很多人的指點，上面是我這幾天做光譜是自己總結(jié)的一些東西，可能沒太有什么用，我也就是下午閑著沒事寫寫，咱們共同交流，共同進步。不正確的地方，還請指點，謝謝。 |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺，不對該內(nèi)容負責。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識產(chǎn)權(quán)問題，其責任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 電子激發(fā)任務(wù)中軌道躍遷貢獻的計算.doc
- 附件 2 : 高斯優(yōu)化s1和t1的問題.doc
- 附件 3 : 畫吸圖像和發(fā)射圖像.doc
- 附件 4 : 激發(fā)態(tài)優(yōu)化出錯-you-need-solve-more.pdf
- 附件 5 : 先理解知識.doc
- 附件 6 : scf不收斂和幾何構(gòu)型優(yōu)化不收斂問題的解決來自總結(jié).pdf
2015-06-19 18:00:46, 31 K
2015-06-19 18:00:46, 29.5 K
2015-06-19 18:00:48, 152 K
2015-06-19 18:00:49, 1.04 M
2015-06-19 18:00:49, 24.5 K
2015-06-19 18:00:49, 537.54 K
» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 有機資源 | 計算 | 化學污染與環(huán)境健康 | 經(jīng)驗 |
| 計算化學 | 不懂計算 | 自己感覺好的東西 | 計算化學好高大上呀 |
| 高斯相關(guān) | 光譜模擬+數(shù)據(jù)分析 | 熒光計算 | 有用的帖子 |
| 計算菜鳥 | 量化計算 | 量子化學基礎(chǔ)問題 | 高斯應(yīng)用 |
| 計算模擬 | 基金申請資料搜集 | 高斯研究 | DFT計算 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
czyzsu» 猜你喜歡
深圳理工大學招聘AI4Science與分子模擬方向科研人員
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
全獎博士 英國利物浦大學 × 臺灣清華大學 聯(lián)合培養(yǎng)
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
物理化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有64人回復(fù)
-
尋博導(dǎo)
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
基金正文30頁指的是報告正文還是整個申請書
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
哈爾濱工業(yè)大學（深圳）綠色化學團隊招收2026年秋季入學博士生
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
澳大利亞昆士蘭科技大學PhD博士獎學金
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 高斯09怎么計算模擬磷光光譜？和熒光光譜一樣嗎？謝謝指點
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 用高斯09計算手冊中乙醛在乙醇溶液中的熒光光譜的問題
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 怎樣用高斯在計算配合物的UV光譜時，只計算某一波長范圍內(nèi)的紫外光譜躍遷
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 給你一個發(fā)射光譜，怎么進行高斯擬合，用origin8.0,
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 用高斯模擬的吸收光譜中，有三個峰出現(xiàn)，請問怎么確定最大吸收波長呢？
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 高斯計算氧化石墨烯紫外吸收光譜
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 高斯軟件計算吸收光譜
已經(jīng)有34人回復(fù)
- 小弟求助關(guān)于確定熒光發(fā)射光譜和激發(fā)光譜的問題------很著急�。。。�！
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 高斯計算出來的UV紫外光譜分析
已經(jīng)有6人回復(fù)
- 新手—高斯仿真紅外光譜
已經(jīng)有31人回復(fù)
- 用高斯計算磷光發(fā)射波長時，振子強度是0，實驗上可以測量磷光光譜的，求交流
已經(jīng)有19人回復(fù)
- 懂納米金紫外光譜得童鞋請進
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 【求助】有些不懂，金納米顆粒有紫外吸收，標記到細胞表面可以用激光共聚焦看見嗎？
已經(jīng)有8人回復(fù)
beefly
專家顧問 (職業(yè)作家)
-
專家經(jīng)驗: +458 - QC強帖: 12
- 應(yīng)助: 88 (初中生)
- 金幣: 13000.7
- 帖子: 4672
- 在線: 926.9小時
- 蟲號: 408372
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
| 做熒光光譜要注意一個問題。吸收光譜、發(fā)射光譜的公式不一樣，不是簡單的常數(shù)換算關(guān)系。參見赫茲堡《分子光譜和分子結(jié)構(gòu)》（卷一）的公式I.48和I.53，兩者相差激發(fā)能的三次方。如果只考慮兩個態(tài)之間的熒光躍遷，激發(fā)能的三次方相當于一個換算因子，不改變發(fā)射光譜分布的形狀。但是不同激發(fā)態(tài)的熒光光譜不能直接做比較，即便乘上各自激發(fā)能的三次方也不行，因為它們還依賴于激發(fā)態(tài)的分布幾率。 |
4樓2015-06-20 00:01:48
| 剛剛沒上傳f90?我在試試 |
» 本帖附件資源列表
-
歡迎監(jiān)督和反饋：小木蟲僅提供交流平臺，不對該內(nèi)容負責。
本內(nèi)容由用戶自主發(fā)布，如果其內(nèi)容涉及到知識產(chǎn)權(quán)問題，其責任在于用戶本人，如對版權(quán)有異議，請聯(lián)系郵箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : zhankai.f90
2015-06-19 18:01:59, 1.79 K
2樓2015-06-19 18:02:22
謝謝beefly大神的指點。5樓2015-06-20 07:19:12
6樓2015-06-20 09:06:38
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 287求調(diào)劑 +4 | 晨昏線與星海 2026-03-19 | 5/250 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 廣西大學家禽遺傳育種課題組2026年碩士招生（接收計算機專業(yè)調(diào)劑） +3 | 123阿標 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +8 | S.H1 2026-03-18 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +4 | ^O^乜 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 288求調(diào)劑 +15 | 于海海海海 2026-03-19 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿天津大學化學工藝專業(yè)（081702）315分求調(diào)劑 +11 | yangfz 2026-03-17 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 化學求調(diào)劑 +3 | 臨澤境llllll 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 +5 | pupcoco 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 材料考研調(diào)劑 +3 | xwt。 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿天大材料與化工（085600）總分338 +5 | 蔡大美女 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿985，本科211，0817化學工程與技術(shù)319求調(diào)劑 +10 | Liwangman 2026-03-15 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | ydfyh 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑，求各位老師收留 +10 | 秋有木北 2026-03-14 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 08工科 320總分 求調(diào)劑 +5 | 梨花珞晚風 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 0854可跨調(diào)劑，一作一項核心論文五項專利，省、國級證書40+數(shù)一英一287 +8 | 小李0854 2026-03-16 | 8/400 |
|
|
|
[考博] 26博士申請 +3 | 1042136743 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請]
今年的國基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 277材料科學與工程080500求調(diào)劑 +3 | 自由煎餅果子 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學調(diào)劑 290分有科研經(jīng)歷，論文在投 +7 | 膩膩gk 2026-03-14 | 7/350 |
|