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[求助] 用Origin怎么做這樣的HOMO-LUMO能級圖？求詳細已有2人參與

我是用Gaussian算出來的結(jié)果想要做出這樣的圖。請詳細教授，謝謝了�。。�

Z{OLX0__%)JVL{)R6G~6R81.png

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1樓 2015-06-23 15:44:04

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小范范1989

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

1：從你的log文件中，找到如下的表述：
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.41160  -0.41003  -0.40475  -0.40430  -0.40417
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.40379  -0.40290  -0.39842  -0.39804  -0.39458
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.39440  -0.39419  -0.39259  -0.38971  -0.38854
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.37816  -0.37801  -0.37355  -0.37332  -0.36794
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.36549  -0.35652  -0.34648  -0.32921  -0.32739
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.32367  -0.32279  -0.31354  -0.31335  -0.29704
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.29622  -0.29324  -0.28800  -0.28353  -0.28338
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.25827  -0.25767  -0.25536  -0.25429  -0.24041
Alpha  occ. eigenvalues -- -0.24023  -0.22502  -0.22458
Alpha virt. eigenvalues -- -0.05754  -0.03972  -0.02434  -0.02300  -0.01075
Alpha virt. eigenvalues -- -0.01057 0.00541 0.00872 0.01059 0.01677
Alpha virt. eigenvalues -- 0.02628 0.02645 0.04299 0.04403 0.05251
Alpha virt. eigenvalues -- 0.05487 0.05969 0.06093 0.06690 0.06719
Alpha virt. eigenvalues -- 0.11598 0.11953 0.12239 0.12785 0.12904
Alpha virt. eigenvalues -- 0.13369 0.13512 0.13561 0.13639 0.14255
Alpha virt. eigenvalues -- 0.14826 0.15297 0.16253 0.16310 0.17036
當(dāng)然，數(shù)據(jù)可以更多或者更少。
2：在origin】中，x坐標(biāo)全部設(shè)置為1  Y坐標(biāo)就把上面的數(shù)據(jù)輸入，置于輸入多少或者單位換算，這些你應(yīng)該都知道。然后點擊作圖，作出來的應(yīng)該是全是一些小點點。
3：origin中雙擊，設(shè)置symbol中的size，以及昨天這個倒三角形的樣式，改為橫線就ok了

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2樓2015-06-23 16:34:52

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小范范1989

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sorry，第三條中的昨天，打錯了，是左邊。
ps：上面是我做能級圖的時候的方式，不一定準(zhǔn)確，希望高手們多多指點。

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3樓2015-06-23 16:36:08

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lastzealot

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引用回帖:

3樓: Originally posted by 小范范1989 at 2015-06-23 16:36:08
sorry，第三條中的昨天，打錯了，是左邊。
ps：上面是我做能級圖的時候的方式，不一定準(zhǔn)確，希望高手們多多指點。

你好，你幫我回答過好多問題了，首先謝謝你。
在這里又遇到你了，順便問你個問題吧。
我也在做NBO分析，但是剛剛開始學(xué)習(xí)NBO。
1. NBO分析的關(guān)鍵詞是不是pop=nbo還是nboread還是其他的什么？
2. 分析數(shù)據(jù)時哪些時候需要把.chk文件變成.fchk文件呢？請問如何變幻？哪些時候直接分析.chk就可以了？
3. 計算完nbo的.out文件里是否有關(guān)于HOMO-LUMO前線軌道的數(shù)據(jù)呢？請問如何把數(shù)據(jù)提取出來呢？

謝謝，別笑話我哦~~~~~~~~~

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4樓2015-06-23 22:04:56

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chw5842036

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【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

引用回帖:

4樓: Originally posted by lastzealot at 2015-06-23 22:04:56
你好，你幫我回答過好多問題了，首先謝謝你。
在這里又遇到你了，順便問你個問題吧。
我也在做NBO分析，但是剛剛開始學(xué)習(xí)NBO。
1. NBO分析的關(guān)鍵詞是不是pop=nbo還是nboread還是其他的什么？
2. 分析數(shù)據(jù)時哪些 ...

你說的nbo可以在高斯view中選擇，里面有nbo這個選擇，至于fchk，一般都是在Linux系統(tǒng)吧chk文件轉(zhuǎn)換成fchk，因為在win下只能打開Linux系統(tǒng)運行的fchk文件，格式是formchk 文件加上chk 文件加上fchk, 看軌道的話需要fchk文件才能查看，out文件是不能查看的

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相信自己，不放棄

5樓2015-06-23 22:30:36

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lastzealot

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引用回帖:

5樓: Originally posted by chw5842036 at 2015-06-23 22:30:36
你說的nbo可以在高斯view中選擇，里面有nbo這個選擇，至于fchk，一般都是在Linux系統(tǒng)吧chk文件轉(zhuǎn)換成fchk，因為在win下只能打開Linux系統(tǒng)運行的fchk文件，格式是formchk 文件加上chk 文件加上fchk, 看軌道的話需要 ...

謝謝你得幫助，但是我還是沒看懂
1. gview里面哪里有nbo選項？我怎么沒找到？
2. 在linux系統(tǒng)下請問如何把chk轉(zhuǎn)換成fchk，用哪個命令呢？
formchk file.chk file.fchk
請問是這種格式嗎？
3. 轉(zhuǎn)換成fchk后是不是用gview打開就可以了？

謝謝

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6樓2015-06-23 22:53:10

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你客氣了，我們交流問題，怎么會有笑話之說的。誰都是從不懂開始，慢慢接觸，最后到熟悉，最后的術(shù)業(yè)專攻。
1：這個NBO的計算是一個很重要的計算，我當(dāng)時也是偶爾看看，因為我還沒有真正的用到，你看看sob老師的這個帖子
http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=102
以及小木蟲beefly大神的帖子，等等
http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1585328
2：轉(zhuǎn)化為fchk，需要用到高斯自帶的formchk程序，你要是再linux下轉(zhuǎn)換，需要用到/路徑/formchk file.chk file.fchk
要是再window下轉(zhuǎn)化，有個utilities 里面的formchk就可以轉(zhuǎn)換了
3：可以吧計算的log文件（或者是out文件），放到高斯view中，然后點擊一個類似于8的按鈕，上面是綠色，下面是紅色，在高斯view的第四行，會出現(xiàn)一個圖像，里面有分子軌道，你一看就明白了

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7樓2015-06-24 07:47:03

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lastzealot

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7樓: Originally posted by 小范范1989 at 2015-06-24 07:47:03
你客氣了，我們交流問題，怎么會有笑話之說的。誰都是從不懂開始，慢慢接觸，最后到熟悉，最后的術(shù)業(yè)專攻。
1：這個NBO的計算是一個很重要的計算，我當(dāng)時也是偶爾看看，因為我還沒有真正的用到，你看看sob老師的 ...

非常感謝，我找到那個8了。

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8樓2015-06-24 10:02:13

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樓主好，想請問一下這樣的能級圖能得到什么樣的信息呢?
和lomo homo軌道圖要結(jié)合分析嗎？
非常感謝

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9樓2015-06-24 11:21:27

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