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菜鳥(niǎo)都不算新蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
用Origin怎么做這樣的HOMO-LUMO能級(jí)圖？求詳細(xì) 已有2人參與
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我是用Gaussian算出來(lái)的結(jié)果想要做出這樣的圖。請(qǐng)?jiān)敿?xì)教授，謝謝了�。。� Z{OLX0__%)JVL{)R6G~6R81.png |
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小范范1989
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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1：從你的log文件中，找到如下的表述： Alpha occ. eigenvalues -- -0.41160 -0.41003 -0.40475 -0.40430 -0.40417 Alpha occ. eigenvalues -- -0.40379 -0.40290 -0.39842 -0.39804 -0.39458 Alpha occ. eigenvalues -- -0.39440 -0.39419 -0.39259 -0.38971 -0.38854 Alpha occ. eigenvalues -- -0.37816 -0.37801 -0.37355 -0.37332 -0.36794 Alpha occ. eigenvalues -- -0.36549 -0.35652 -0.34648 -0.32921 -0.32739 Alpha occ. eigenvalues -- -0.32367 -0.32279 -0.31354 -0.31335 -0.29704 Alpha occ. eigenvalues -- -0.29622 -0.29324 -0.28800 -0.28353 -0.28338 Alpha occ. eigenvalues -- -0.25827 -0.25767 -0.25536 -0.25429 -0.24041 Alpha occ. eigenvalues -- -0.24023 -0.22502 -0.22458 Alpha virt. eigenvalues -- -0.05754 -0.03972 -0.02434 -0.02300 -0.01075 Alpha virt. eigenvalues -- -0.01057 0.00541 0.00872 0.01059 0.01677 Alpha virt. eigenvalues -- 0.02628 0.02645 0.04299 0.04403 0.05251 Alpha virt. eigenvalues -- 0.05487 0.05969 0.06093 0.06690 0.06719 Alpha virt. eigenvalues -- 0.11598 0.11953 0.12239 0.12785 0.12904 Alpha virt. eigenvalues -- 0.13369 0.13512 0.13561 0.13639 0.14255 Alpha virt. eigenvalues -- 0.14826 0.15297 0.16253 0.16310 0.17036 當(dāng)然，數(shù)據(jù)可以更多或者更少。 2：在origin】中，x坐標(biāo)全部設(shè)置為1 Y坐標(biāo)就把上面的數(shù)據(jù)輸入，置于輸入多少或者單位換算，這些你應(yīng)該都知道。然后點(diǎn)擊作圖，作出來(lái)的應(yīng)該是全是一些小點(diǎn)點(diǎn)。 3：origin中雙擊，設(shè)置symbol中的size，以及昨天這個(gè)倒三角形的樣式，改為橫線就ok了 |
2樓2015-06-23 16:34:52
小范范1989
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你好，你幫我回答過(guò)好多問(wèn)題了，首先謝謝你。 在這里又遇到你了，順便問(wèn)你個(gè)問(wèn)題吧。 我也在做NBO分析，但是剛剛開(kāi)始學(xué)習(xí)NBO。 1. NBO分析的關(guān)鍵詞是不是pop=nbo還是nboread還是其他的什么？ 2. 分析數(shù)據(jù)時(shí)哪些時(shí)候需要把.chk文件變成.fchk文件呢？請(qǐng)問(wèn)如何變幻？哪些時(shí)候直接分析.chk就可以了？ 3. 計(jì)算完nbo的.out文件里是否有關(guān)于HOMO-LUMO前線軌道的數(shù)據(jù)呢？請(qǐng)問(wèn)如何把數(shù)據(jù)提取出來(lái)呢？ 謝謝，別笑話我哦~~~~~~~~~ |
4樓2015-06-23 22:04:56
chw5842036
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6樓2015-06-23 22:53:10
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你客氣了，我們 交流問(wèn)題，怎么會(huì)有笑話之說(shuō)的。誰(shuí)都是從不懂開(kāi)始，慢慢接觸，最后到熟悉，最后的術(shù)業(yè)專攻。 1：這個(gè)NBO的計(jì)算是一個(gè)很重要的計(jì)算，我當(dāng)時(shí)也是偶爾看看，因?yàn)槲疫�沒(méi)有真正的用到，你看看sob老師的這個(gè)帖子 http://ccc.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=102 以及小木蟲(chóng)beefly大神的帖子，等等 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=1585328 2：轉(zhuǎn)化為fchk，需要用到高斯自帶的formchk程序，你要是再linux下轉(zhuǎn)換，需要用到/路徑/formchk file.chk file.fchk 要是再window下轉(zhuǎn)化，有個(gè)utilities 里面的formchk就可以轉(zhuǎn)換了 3：可以吧計(jì)算的log文件（或者是out文件），放到高斯view中，然后點(diǎn)擊一個(gè)類似于8的按鈕，上面是綠色，下面是紅色，在高斯view的第四行，會(huì)出現(xiàn)一個(gè)圖像，里面有分子軌道，你一看就明白了 |
7樓2015-06-24 07:47:03
lastzealot
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9樓2015-06-24 11:21:27
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