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幫忙分析一些分子的靜電勢(shì)和分子軌道圖。。非常感謝 已有1人參與
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我分析醋酸乙烯分子結(jié)構(gòu)中的碳碳雙鍵和酯基氧原子的共軛效應(yīng)。 通過(guò)高斯得到了該分子的靜電勢(shì)圖和分子軌道圖，如下。但是不知道怎么分析。 還有分子的HOMO軌道圖，覺(jué)得好怪異，怎么是這個(gè)形狀，感覺(jué)還有一塊布折疊出一個(gè)洞一樣，這樣的形狀有什么特殊的含義嗎？ 對(duì)高斯不做深入研究，只為得到一個(gè)結(jié)論，希望大俠們能夠詳細(xì)為我解答，金幣不夠還可以續(xù)加。非常感謝。 homo軌道圖.JPG lomo軌道側(cè)視圖.JPG 醋酸乙烯靜電勢(shì)圖.JPG |
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 高斯 |
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zhou2009
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
gmy1990: 金幣+3, 感謝應(yīng)助 2015-06-24 17:09:02
gx730: 金幣+50, ★★★很有幫助, 謝謝您的幫助。請(qǐng)問(wèn)那我應(yīng)該從什么方便分析醋酸乙烯分子碳碳雙鍵和酯氧原子的共軛？ 還有就是如何分析醋酸乙烯分子的色散力，分子間的相互作用？醋酸乙烯的靜電勢(shì)圖看出羰基氧比較活潑，那這個(gè)分子能夠形成氫鍵嗎，如何判定。 2015-06-24 17:34:05
gx730: 金幣+50, ★★★★★最佳答案, 謝謝 希望再給點(diǎn)建議 2015-06-24 21:38:11
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gx730: 金幣+50, ★★★★★最佳答案, 謝謝 希望再給點(diǎn)建議 2015-06-24 21:38:11
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1、圖1HOMO軌道圖沒(méi)有正確作出。此圖這個(gè)樣子，因有錯(cuò)不能說(shuō)明什么問(wèn)題。 2、圖2標(biāo)示“l(fā)omo軌道側(cè)視圖”，是LUMO嗎？我感到似乎這才是HOMO。它除了表明>C=O與=CH-O-有點(diǎn)共軛外，其它都是反相位、反鍵的。 3、分子的成鍵性質(zhì)，像碳碳雙鍵和酯基氧原子的共軛效應(yīng)，作為共軛效應(yīng)，它的能級(jí)較低，并不一定在HOMO。HOMO、LUMO都不能看到像碳碳雙鍵和酯基氧原子的共軛效應(yīng)，而是出現(xiàn)在HOMO以下的軌道。 4、圖3靜電勢(shì)圖表明：羰基氧處為負(fù)值，此處電子易給出，比如形成氫鍵。其它各處都比較穩(wěn)定。 5、對(duì)于MO，HOMO、LUMO并不能表達(dá)分子的全面性質(zhì)，它只是表明分子的反應(yīng)性、活性。對(duì)于分子的其它性質(zhì)，如單鍵、雙鍵、碳碳雙鍵和酯基氧原子的共軛效應(yīng)等，它們的MO能級(jí)都很低，都在HOMO之下，與HOMO不同，不能通過(guò)HOMO來(lái)分析它們。 |
2樓2015-06-24 11:54:16
送紅花一朵 |
謝謝您。 圖1HOMO軌道圖 我就是在.chk高斯優(yōu)化后的分子.chk文件上，在GaussianViews 里的results-surface and contours-new cube里得到的，出來(lái)的就是這個(gè)樣子。這三個(gè)圖都是在一個(gè)分子.chk文件上上得到的。 為什么會(huì)出現(xiàn)這個(gè)問(wèn)題呢？是軟件的問(wèn)題還是優(yōu)化結(jié)構(gòu)的時(shí)候沒(méi)有優(yōu)化好？ 假如想從量化角度分析雙鍵碳和烯酯氧的共軛，應(yīng)該從什么角度進(jìn)行分析？ 還有就是可以從什么方面對(duì)醋酸乙烯的范德華相互作用進(jìn)行研究？ |
3樓2015-06-24 17:41:01
4樓2015-06-24 17:58:40
zhou2009
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5樓2015-06-24 20:29:44
6樓2015-06-24 21:25:28
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圖1，electrostatic popential from total scf density。靜電勢(shì)的數(shù)值比電子密度的值要大好幾個(gè)數(shù)量級(jí)，如果靜電勢(shì)等值面值按電子密度的值取得太小，就會(huì)出現(xiàn)這種怪圖。GV靜電勢(shì)作圖處有一個(gè)比例因子，如取0.01，它將靜電勢(shì)的數(shù)值統(tǒng)一縮小，才會(huì)正確，像圖2那樣。 圖2，上次已經(jīng)說(shuō)了，靜電勢(shì)圖表明：羰基氧處為負(fù)值，此處電子易給出，比如形成氫鍵。其它各處都比較穩(wěn)定。 靜電勢(shì)圖也是分子外表整體的反應(yīng)性、活性，不能反映雙鍵碳和烯酯氧的共軛等性質(zhì)。 雙鍵碳和烯酯氧的共軛還是要找HOMO以下的軌道，那里就有雙鍵碳和烯酯氧的共軛的軌道，是哪一個(gè)還要具體去查找。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
7樓2015-06-25 09:07:08
8樓2015-06-25 11:40:06
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