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ct_kaoyan金蟲 (小有名氣)
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[求助]
找一個互變異構反應過渡態(tài)結構 已有1人參與
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我現要要計算下面反應的過渡態(tài)，我分別用TS，QST2和QST3方法找過渡態(tài)。找到兩種過渡態(tài)ts1和ts2，不不知道正確與否，ts1用gview查看負虛頻震動方向是H原子在20號碳原子和21號氧原子之間震動，如下圖ts1；ts2是用gview查看負虛頻震動方向氫原子在20號碳原子和8號碳原子之間震動，如下圖ts2。請問哪種正確？或者兩種都不正確，正確的過渡態(tài)的氫原子是不是應該在碳8和氧21之間震動？請有經驗的量化高手解答，非常感謝��！ 反應.png ts1.png ts2.png |
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ct_kaoyan
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2樓2015-07-03 21:18:58
【答案】應助回帖
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感謝參與，應助指數 +1
ct_kaoyan: 金幣+50, ★★★很有幫助, 謝謝你的答復！ 2015-07-08 20:10:15
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兩個看起來都似乎是反應路徑中的一環(huán)，所以可以試試以下幾步： 1）如果ts1和ts2各自虛頻都正常（有且僅有一負），可以各做irc，看看是不是ts1的反應物向和ts2的生成物向有結構一致。如果有，那就是中間態(tài)了。 2）如果irc找不到一致性，或者說很可能沒有中間態(tài)，則ts1對／ts2對／ts1,2都不對。 3）假設ts1和ts2有一個正確，只要比較能量取高即可。 4）都不對也有可能？那就需要柔性掃描了，掃H和8號C的距離，或者掃H和O的距離，應該都可以。有條件也可以嘗試二維柔性掃描。 |
3樓2015-07-05 00:17:57
ct_kaoyan
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4樓2015-07-08 20:09:34
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ct_kaoyan
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7樓2015-07-13 20:35:54
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