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ct_kaoyan金蟲 (小有名氣)
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[求助]
找一個(gè)互變異構(gòu)反應(yīng)過渡態(tài)結(jié)構(gòu) 已有1人參與
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我現(xiàn)要要計(jì)算下面反應(yīng)的過渡態(tài)，我分別用TS，QST2和QST3方法找過渡態(tài)。找到兩種過渡態(tài)ts1和ts2，不不知道正確與否，ts1用gview查看負(fù)虛頻震動(dòng)方向是H原子在20號(hào)碳原子和21號(hào)氧原子之間震動(dòng)，如下圖ts1；ts2是用gview查看負(fù)虛頻震動(dòng)方向氫原子在20號(hào)碳原子和8號(hào)碳原子之間震動(dòng)，如下圖ts2。請(qǐng)問哪種正確？或者兩種都不正確，正確的過渡態(tài)的氫原子是不是應(yīng)該在碳8和氧21之間震動(dòng)？請(qǐng)有經(jīng)驗(yàn)的量化高手解答，非常感謝�。� 反應(yīng).png ts1.png ts2.png |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
ct_kaoyan: 金幣+50, ★★★很有幫助, 謝謝你的答復(fù)！ 2015-07-08 20:10:15
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兩個(gè)看起來(lái)都似乎是反應(yīng)路徑中的一環(huán)，所以可以試試以下幾步： 1）如果ts1和ts2各自虛頻都正常（有且僅有一負(fù)），可以各做irc，看看是不是ts1的反應(yīng)物向和ts2的生成物向有結(jié)構(gòu)一致。如果有，那就是中間態(tài)了。 2）如果irc找不到一致性，或者說(shuō)很可能沒有中間態(tài)，則ts1對(duì)／ts2對(duì)／ts1,2都不對(duì)。 3）假設(shè)ts1和ts2有一個(gè)正確，只要比較能量取高即可。 4）都不對(duì)也有可能？那就需要柔性掃描了，掃H和8號(hào)C的距離，或者掃H和O的距離，應(yīng)該都可以。有條件也可以嘗試二維柔性掃描。 |
3樓2015-07-05 00:17:57
ct_kaoyan
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2樓2015-07-03 21:18:58
ct_kaoyan
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4樓2015-07-08 20:09:34
5樓2015-07-08 21:15:26
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