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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 量子化學 » 量化新手直通車 » 繪制反應機理勢能面的小工具
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jerkwin專家顧問 (正式寫手)
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[交流]
繪制反應機理勢能面的小工具 已有6人參與
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在使用量子化學計算反應機理的論文中, 經(jīng)常需要繪制反應的勢能面(或稱勢能剖面圖). 我以前也做過從頭算方面的工作, 曾經(jīng)寫了一個Fortran小程序用來幫助繪制勢能面. 主要思路是給出各個反應物種的能量及相對位置, 然后使用程序生成Origin的數(shù)據(jù)文件, 將數(shù)據(jù)文件導入Origin就可以直接繪出勢能面了. 現(xiàn)在我基本已經(jīng)不再做從頭算方面的工作了, 所以這個小程序已經(jīng)很長時間未用了, 一直躺在我電腦的某個文件夾中. 可時不時地, 我還會看到有人請教有了計算結果之后如何畫反應的勢能面. 網(wǎng)上給出的答案有ChemDraw, Origin甚至PowerPoint. 當然, 如果你有閑情逸致, 用Windows自帶的畫圖軟件也是可以做出很漂亮的圖的. 但那不是我喜歡的方式. 既然我已經(jīng)不再畫勢能面了, 這個小程序放在我這里也就沒多大用處了. 所以, 我就花了點時間, 將其改造成了一個網(wǎng)上的在線工具, 你可以在直接在瀏覽器中編輯控制文件, 然后看到繪制效果. 程序還會給出用于Origin的數(shù)據(jù)文件, 將其導入Origin就可以使用Origin作圖了. 我現(xiàn)在將這個小工具放在這里, 希望能對那些需要繪制勢能面的人有所幫助. 網(wǎng)址: http://jerkwin.github.io/2015/07 ... %E5%B7%A5%E5%85%B7/ |
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2樓2015-07-16 08:07:12
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3樓2015-07-16 11:09:50
debai
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4樓2015-07-16 17:01:29
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5樓2015-07-17 07:08:46
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6樓2016-09-29 14:32:22
乙酰苯胺
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8樓2016-10-28 09:30:48
jerkwin
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9樓2016-10-28 12:07:03
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