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免疫共沉淀實驗原理、基本步驟及注意事項 已有3人參與
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免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)是以抗體和抗原之間的專一性作用為基礎(chǔ)的用于研究蛋白質(zhì)相互作用的經(jīng)典方法。是確定兩種蛋白質(zhì)在完整細(xì)胞內(nèi)生理性相互作用的有效方法。其原理是:當(dāng)細(xì)胞在非變性條件下被裂解時,完整細(xì)胞內(nèi)存在的許多蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)間的相互作用被保留了下來。如果用蛋白質(zhì)X的抗體免疫沉淀X,那么與X在體內(nèi)結(jié)合的蛋白質(zhì)Y也能沉淀下來。目前多用精制的proreinA預(yù)先結(jié)合固化在argarose的beads上,使之與含有抗原的溶液及抗體反應(yīng)后,beads上的proreinA就能吸附抗原達到精制的目的。這種方法常用于測定兩種目標(biāo)蛋白質(zhì)是否在體內(nèi)結(jié)合;也可用于確定一種特定蛋白質(zhì)的新的作用搭檔。 一、試劑準(zhǔn)備 1. 預(yù)冷PBS,RIPA Buffer,細(xì)胞刮子(用保鮮膜包好后,埋冰下),離心機。 2. 用預(yù)冷的PBS洗滌細(xì)胞兩次,最后一次吸干PBS。 3. 加入預(yù)冷的RIPA Buffer(1 ml/107個細(xì)胞、10 cm培養(yǎng)皿或150 cm2培養(yǎng)瓶,0.5 ml/5×106個細(xì)胞、6 cm培養(yǎng)皿、75 cm2培養(yǎng)瓶)。 4. 用預(yù)冷的細(xì)胞刮子將細(xì)胞從培養(yǎng)皿或培養(yǎng)瓶上刮下,把懸液轉(zhuǎn)到1.5EP管中,4℃,緩慢晃動15 min(EP管插冰上,置水平搖床上)。 5. 4℃,14000 g離心15 min,立即將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中。 6. 準(zhǔn)備Protein A agarose,用PBS 洗兩遍珠子,然后用PBS配制成50%濃度,建議減掉槍尖部分,避免在涉及瓊脂糖珠的操作中破壞瓊脂糖珠。 7. 每1 ml總蛋白中加入100 μl Protein A瓊脂糖珠(50%),4℃搖晃10 min(EP管插冰上,置水平搖床上),以去除非特異性雜蛋白,降低背景。 8. 4℃,14000 g離心1 5min,將上清轉(zhuǎn)移到一個新的離心管中,去除Protein A珠子。 9. (Bradford 法)做蛋白標(biāo)準(zhǔn)曲線,測定蛋白濃度,測前將總蛋白至少稀釋1:10倍以上,以減少細(xì)胞裂解液中去垢劑的影響(定量,分裝后,可以在-20℃保存一個月)。 10. 用PBS將總蛋白稀釋到約1 μg/μl,以降低裂解液中去垢劑的濃度,如果興趣蛋白在細(xì)胞中含量較低,則總蛋白濃度應(yīng)該稍高(如10 μg/μl)。 11. 加入一定體積的兔抗到500 μl總蛋白中,抗體的稀釋比例因興趣蛋白在不同細(xì)胞系中的多少而異。 12. 4℃緩慢搖動抗原抗體混合物過夜或室溫2h,激酶或磷酸酯酶活性分析建議用2 h室溫孵育。 13. 加入100 μl Protein A瓊脂糖珠來捕捉抗原抗體復(fù)合物,4℃緩慢搖動抗原抗體混合物過夜或室溫1 h,如果所用抗體為鼠抗或雞抗,建議加2 μl"過渡抗體"(兔抗鼠IgG,兔抗雞IgG)。 14. 14000 rpm瞬時離心5 s,收集瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物,去上清,用預(yù)冷的RIPA buffer洗3遍,800 μl/遍,RIPA buffer有時候會破壞瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物內(nèi)部的結(jié)合,可以使用PBS。 15. 用60 μl 2×上樣緩沖液將瓊脂糖珠-抗原抗體復(fù)合物懸起,輕輕混勻,緩沖液的量依據(jù)上樣多少的需要而定(60 μl足夠上三道)。 16. 將上樣樣品煮5 min,以游離抗原,抗體,珠子,離心,將上清電泳,收集剩余瓊脂糖珠,上清也可以暫時凍-20℃,留待以后電泳,電泳前應(yīng)再次煮5 min變性。 二、免疫共沉淀反應(yīng) 1. 轉(zhuǎn)染后24-48 h 可收獲細(xì)胞,加入適量細(xì)胞裂解緩沖液(含蛋白酶抑制劑),冰上裂解30 min,細(xì)胞裂解液于4°C,最大轉(zhuǎn)速離心30 min后取上清; 2. 取少量裂解液以備Western blot分析,剩余裂解液加1μg相應(yīng)的抗體加入到細(xì)胞裂解液,4°C緩慢搖晃孵育過夜; 3. 取10 μl protein A 瓊脂糖珠,用適量裂解緩沖液洗3 次,每次3 000 rpm離心3 min; 4.. 將預(yù)處理過的10μl protein A 瓊脂糖珠加入到和抗體孵育過夜的細(xì)胞裂解液中4°C緩慢搖晃孵育2-4 h,使抗體與protein A瓊脂糖珠偶連; 5. 免疫沉淀反應(yīng)后,在4°C 以3,000 rpm 速度離心3 min,將瓊脂糖珠離心至管底;將上清小心吸去,瓊脂糖珠用1 ml裂解緩沖液洗3-4次;最后加入15 μl的2×SDS 上樣緩沖液,沸水煮5分鐘; 6. SDS-PAGE,Western blotting或質(zhì)譜儀分析。 三、通過免疫共沉淀確定結(jié)合蛋白 1.用磷酸鹽緩沖液洗30塊10 cm培養(yǎng)板上的適宜細(xì)胞。刮去每塊板上的細(xì)胞到1 ml冰冷的EBC裂解緩沖液中; 2.將每毫升細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移到微量離心管中,在微量離心機上4℃以最大速度離心15 ; 3.收集上清(約30 ml)并加入30 μg的適當(dāng)抗體,4℃搖動免疫沉淀物1 h; 4.加入0.9 ml的蛋白質(zhì)A-Sepharose 懸液,4℃搖動免疫沉淀物30 min; 5.用含900 mmol/L NaCl的NETN洗蛋白A-Sepharose混合物,再重復(fù)洗5次。最后,用NETN洗一次; 6.吸出混合物的液體部分。加入800 μl的1×SDS膠加樣緩沖液到球珠中,煮沸4 min; 7.將樣品加入到大孔的不連續(xù)SDS-PAGE梯度膠中,在10 mA的恒定電流下電泳過夜; 8.通過考馬斯亮藍染色觀察蛋白質(zhì)泳帶; 9.從膠上切下目標(biāo)帶,將其放到微量離心管中,用1 ml 50%乙腈洗兩次,每次3 min; 10. 用胰蛋白酶消化膠中的蛋白質(zhì),再將肽電洗脫; 11. 通過窄孔高效液相色譜分離肽。將收集的肽在ABI 477A或494A機器上進行自動Edman降解測序。 四、注意事項: 1. 細(xì)胞裂解采用溫和的裂解條件,不能破壞細(xì)胞內(nèi)存在的所有蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,多采用非離子變性劑(NP40 或Triton X-100)。每種細(xì)胞的裂解條件是不一樣的,通過經(jīng)驗確定。不能用高濃度的變性劑(0.2%SDS),細(xì)胞裂解液中要加各種酶抑制劑,如商品化的。 2. 使用明確的抗體,可以將幾種抗體共同使用。 3. 使用對照抗體: 單克隆抗體:正常小鼠的IgG或另一類單抗 兔多克隆抗體:正常兔IgG 4. 確保共沉淀的蛋白是由所加入的抗體沉淀得到的,而并非外源非特異蛋白,單克隆抗體的使用有助于避免污染的發(fā)生。 5. 要確保抗體的特異性,即在不表達抗原的細(xì)胞溶解物中添加抗體后不會引起共沉淀。 6. 確定蛋白間的相互作用是發(fā)生在細(xì)胞中,而不是由于細(xì)胞的溶解才發(fā)生的,這需要進行蛋白質(zhì)的定位來確定。 |
學(xué)習(xí) | 免疫實驗 |
新蟲 (初入文壇)
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