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pigg9鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
高GC含量DNA序列測(cè)序應(yīng)注意哪些因素
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小弟最近在做幾個(gè)高GC含量DNA的cloning,今天剛剛完成全部的cloning,并跑了帶確認(rèn)長(zhǎng)度沒問題。于是,就開始準(zhǔn)備測(cè)序了。不過小弟以前并沒有做過高GC含量DNA的測(cè)序,不清楚要注意哪些因素(比方說primer改怎么設(shè)計(jì),PCR時(shí)要注意哪些等等之類的),才能保證序列能夠被讀出的同時(shí),亦能保證其可信性(準(zhǔn)確率)。因?yàn)槲覀儗?shí)驗(yàn)室,我是第一個(gè)開始做高GC含量DNA的cloning,周圍能夠請(qǐng)教的人不多。還請(qǐng)各位大神走過路過幫幫小弟一下,萬分感激。 四個(gè)高GC含量DNA片段的長(zhǎng)度都在1600 bp 到1770 bp。而這四個(gè)片段的GC含量分別是,45% (這個(gè)其實(shí)不算高),62%, 75%,78%。我們實(shí)驗(yàn)室測(cè)序PCR用的酶是applied biosystems 的Big Dye.看了官網(wǎng)的說明書未發(fā)現(xiàn)關(guān)于高GC含量DNA做測(cè)序時(shí)的注意事項(xiàng)(也可能是我眼花了)。 還請(qǐng)各位撥冗指點(diǎn)小弟。 謝謝 |
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