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[交流]
amber跑出結果的結合自由能為正值，怎么破？
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amber進行蛋白質和小分子的動力學模擬運算，RMSD后期已趨平穩(wěn)，溫度 密度 勢能的監(jiān)控都很正常， 但是各項能量均為正值，都是正零點幾的樣子，總結合能正一點幾，用PBSA和GBSA兩種，結果都差不多。 這是什么原因導致的呢？是復合物結合系統本身的問題嗎？求助 |
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 本帖僅樓主可見 |
3樓2015-08-26 16:49:08
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4樓2015-08-26 16:57:31
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6樓2015-08-26 16:58:05
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7樓2015-08-26 17:00:29
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8樓2015-08-26 17:01:58
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9樓2015-08-26 17:08:17
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10樓2015-08-26 17:22:15
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