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高橋FC新蟲 (初入文壇)
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[交流]
amber跑出結(jié)果的結(jié)合自由能為正值，怎么破？
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amber進(jìn)行蛋白質(zhì)和小分子的動力學(xué)模擬運(yùn)算，RMSD后期已趨平穩(wěn)，溫度 密度 勢能的監(jiān)控都很正常， 但是各項(xiàng)能量均為正值，都是正零點(diǎn)幾的樣子，總結(jié)合能正一點(diǎn)幾，用PBSA和GBSA兩種，結(jié)果都差不多。 這是什么原因?qū)е碌哪�？是�?fù)合物結(jié)合系統(tǒng)本身的問題嗎？求助 |
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2樓2015-08-26 16:43:36
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 本帖僅樓主可見 |
3樓2015-08-26 16:49:08
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4樓2015-08-26 16:57:31
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5樓2015-08-26 16:57:34
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6樓2015-08-26 16:58:05
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7樓2015-08-26 17:00:29
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8樓2015-08-26 17:01:58
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