 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1543 | 回復(fù): 1 | |||||
hxswdl至尊木蟲 (文壇精英)
Tortoise
|
[求助]
向NCBI提交微生物基因組完成圖方法 已有1人參與
|
|
百度到的文檔都過時了，請有經(jīng)驗的人來幫忙解釋一下，謝謝~ 因為流程與以前不同了，沒有經(jīng)驗的請不要應(yīng)助，請理解  |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
085600 286分 材料求調(diào)劑
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
一志愿河北工業(yè)大學(xué)0817化工278分求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
085601材料工程找調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
材料與化工272求調(diào)劑
已經(jīng)有15人回復(fù)
-
南京大學(xué)化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有14人回復(fù)
-
一志愿北京工業(yè)大學(xué)，324分求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
281求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
26申博自薦
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
一志愿哈爾濱工業(yè)大學(xué)材料與化工方向336分
已經(jīng)有10人回復(fù)
hc-material
專家顧問 (職業(yè)作家)
-
專家經(jīng)驗: +702 - 應(yīng)助: 517 (博士)
- 金幣: 462.9
- 散金: 18028
- 紅花: 313
- 帖子: 3594
- 在線: 518.8小時
- 蟲號: 4027804
- 注冊: 2015-08-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 核技術(shù)及其應(yīng)用
- 管轄: 生物科學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
hxswdl: 金幣+60, ★有幫助, 辛苦分吧，我是要提交基因組，回復(fù)里連關(guān)鍵詞都沒有一個，不過有些方法應(yīng)該可以參考一下的，感謝~ 2015-09-01 21:58:39
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
hxswdl: 金幣+60, ★有幫助, 辛苦分吧，我是要提交基因組，回復(fù)里連關(guān)鍵詞都沒有一個，不過有些方法應(yīng)該可以參考一下的，感謝~ 2015-09-01 21:58:39
|
1、打開NCBI的數(shù)據(jù)提交頁面，DNA和cDNA就是第一個，有兩種方式，Banklt是網(wǎng)頁在線形式，Sequin是本地批量形式，網(wǎng)頁形式的話應(yīng)先點右上角的NCBI注冊，注冊好后再返回到這個頁面點擊Banklt，NCBI將保存你提交的數(shù)據(jù)在你的帳戶，如果一次沒完成，下次登錄后可以繼續(xù)提交，介而網(wǎng)絡(luò)的原因，不推薦這種方式。第二種是用Sequin軟件在本地生成提交信息文件，然后將文件通過郵件的形式發(fā)送給NCBI，這里主要介紹這種方式，Banklt注冊的程序內(nèi)容也和Sequin一樣。 2、下載sequin，如果是windows系統(tǒng)就下載”sequin.win.exe“。 3、雙擊打開程序”sequin”，如果打不開的話，按“win+R”,輸入”cmd”，進入sequin存放的位置。如放這個文件夾中“D:\Program Files\”,首先在剛打開的命令符窗口中輸入”D:”,進入D盤后,輸入”cd Program Files”,進入這個文件夾后，輸入“sequin.exe”就可以了。 4、打開軟件后，點第一行的”Start New Submission”，提交新的序列。 5、在文本域中輸入序列的題目，如果是多序列的話就概括一下，這個關(guān)系不是很大，文章發(fā)表后可以修改這個題目為文章題目，但不填不行；上面有兩個單選按鈕，”Immediately After Processing”是提交后馬上公布，”Release Date”是在規(guī)定的時間之后發(fā)布，如果你提交的序列還沒有寫文章，建議還是選”Release Date”，然后點”Next Page”進行下一步。 6、下一步填寫通訊作者信息，注意中國人的名稱的話，姓是“First Name”，名是”Last Name”，不填”M.I.”,電話和傳真前面加上中國的區(qū)號”+0086″，填好后”Next Page”。 7、在接下來的這個頁面填寫作者信息，Consortium邊的文本框可以不管它，然后點“Next Page”。 8、填寫通訊作者聯(lián)系地址，注意Country應(yīng)填全稱”P.R China”。 9、接下來的這部是”Preparing the Sequences”，選擇”Use the normal submission dialog”，如果是特殊序列，就選擇下面的選項。 10、接下來是”Sequence Format”，如果是提交基因，選擇默認(rèn)的可以了。 11、接下來是”O(jiān)rganism and Sequences”，將你的序列按照格式以FASTA格式保存一個文本文件，例如： 1 >A-0V-1-A [organism=Gallus gallus] [clone=C] 2 TCACTCTTTGGCAACGACCCGTCGTCATAATAAAGATAGAGGGGCAACTAAAGGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGAAAT 3 >A-0V-2-A [organism=Drosophila melanogaster] [strain=D] 4 TCACTCTTTGGCAACGCGTCGTCACAATAAAGATAGAGGGGCAACTAAAGGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGAAAT 如果知道功能，也可在后面加上描述信息，如”Homo sapiens superoxide dismutase 1, soluble (SOD1), mRNA”； 12、接下來選擇測序方法，如果是單個基因測序，一般是”Sanger dideoxy sequencing”，具體的方法可以咨詢測序公司，下面的選項可以先不管。 13、接下來頁面都不要先填，一直點”Next Form”,最后那里填上蛋白名稱和描述信息。 14、在接下來的頁面在Annotate里注釋詳細(xì)的信息就可以了，一般如果是基因的話也只需要填CDS和exon信息就可以了。 15、填好后Save保存，會生成一個以sqn后綴的文件，將這個文件發(fā)給gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov就可以了，郵件不需要寫什么內(nèi)容，寫了別人也不會看，接下來就等著回復(fù)吧，一般五個工作日就會有結(jié)果。 祝順利。 |
2樓2015-08-28 11:39:04
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 hxswdl 的主題更新
| 2 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +9 | 超級伊昂大王 2026-03-24 | 10/500 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷 +7 | cccchenso 2026-03-29 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +11 | 田洪有 2026-03-26 | 11/550 |
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +13 | zhn03 2026-03-25 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué) +11 | 妮妮ninicgb 2026-03-27 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動285求調(diào)劑 +7 | AZMK 2026-03-28 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 347求調(diào)劑 +3 | 山頂見α 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0856，材料與化工321分求調(diào)劑 +12 | 大饞小子 2026-03-27 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +6 | HanBeiNingZC 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 315分求調(diào)劑 +7 | 26考研上岸版26 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +5 | 哇盧卡庫 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉大071010，316分求調(diào)劑 +3 | xgbiknn 2026-03-27 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +11 | junqihahaha 2026-03-26 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 化學(xué)調(diào)劑一志愿上海交通大學(xué)336分-本科上海211 +4 | 小魚愛有機 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +6 | 藍山月 2026-03-25 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料與化工304求B區(qū)調(diào)劑 +3 | 邱gl 2026-03-25 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉大化學(xué)322求調(diào)劑 +4 | 17501029541 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿國科過程所081700，274求調(diào)劑 +3 | 三水研0水立方 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[論文投稿] 急發(fā)核心期刊論文 +3 | 賢達問津 2026-03-23 | 5/250 |
|