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說好de新蟲 (小有名氣)
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[求助]
擴(kuò)散系數(shù)模擬值與實(shí)驗(yàn)值、公式計算值有誤差 已有2人參與
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我在用MS模擬有機(jī)蒸氣（例如正己烷）在空氣中的擴(kuò)散系數(shù)。 我是這樣做的：建立模型，能力最小化，常溫下跑NPT，之后再動力學(xué)跑NVT，最后根據(jù)MSD-TIME斜率求出擴(kuò)散系數(shù)，但是擴(kuò)散系數(shù)模擬值與實(shí)驗(yàn)值、公式計算值之間有較大誤差，實(shí)驗(yàn)值、公式計算值是模擬值的3~5倍，請問還要怎么樣進(jìn)一步再改進(jìn)，使得模擬值跟實(shí)驗(yàn)值、公式計算值更接近一些？請求大家指導(dǎo)，謝謝！ 還有就是請問我想要用現(xiàn)在的模擬結(jié)果發(fā)表文章的話，會好發(fā)嗎？ |
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5樓2015-09-11 19:17:40
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2樓2015-09-10 10:45:26
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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我個人認(rèn)為NVE系綜下的結(jié)果會更好一些，這樣沒有溫度的外界影響 MSD計算屬于相關(guān)函數(shù)計算，需要有大量的數(shù)據(jù)點(diǎn)：長的模擬時間，小的輸出間隔 MSD取值范圍是個比較麻煩的事情，但是最好符合一個原則：log（MSD）- log（t）作圖，其斜率盡可能接近1。這是擴(kuò)散系數(shù)公式（MSD/t /6）成立的前提，如果偏離很遠(yuǎn)的話，除以6算出來的擴(kuò)散系數(shù)是不對的 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
3樓2015-09-11 16:31:21
說好de
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4樓2015-09-11 19:06:53
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