 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 5408 | 回復(fù): 13 | |||
[求助]
請(qǐng)教slab模型的測(cè)試等問題 已有2人參與
|
|||
|
學(xué)生用的是ms建表面模型，vasp計(jì)算，在此請(qǐng)教各路大神slab模型的測(cè)試等問題： ①測(cè)試表面slab模型的真空層厚度，slab厚度和弛豫的原子層厚度的時(shí)候需要進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化嗎，還是直接靜態(tài)計(jì)算，測(cè)試好后再優(yōu)化？如果需要優(yōu)化那計(jì)算量相當(dāng)龐大，如果不優(yōu)化也就是不進(jìn)行弛豫那就測(cè)不出要弛豫多少層原子？然后測(cè)試時(shí)關(guān)注的是表面能和層間距？看了很多貼還是很暈頭，具體這些測(cè)試是怎么個(gè)測(cè)法，還請(qǐng)有經(jīng)驗(yàn)的大神們?cè)敿?xì)告知。拜謝了！  ②建構(gòu)的slab模型需要嚴(yán)格按照化學(xué)計(jì)量比嗎？是否需要先保證化學(xué)計(jì)量比之后才考慮對(duì)稱性和極性的問題？然后是否在測(cè)試slab厚度也需要保證選取的厚度都符合化學(xué)計(jì)量比？ ③極性面是不是在真實(shí)情況下不能穩(wěn)定存在，所以需要通過表面重構(gòu)來使表面穩(wěn)定，才能算出表面能？對(duì)應(yīng)到計(jì)算中就沒法得到一個(gè)收斂的表面能，所以需要進(jìn)行偶極矩矯正才能得到穩(wěn)定的表面能，那么這個(gè)偶極矩矯正和表面重構(gòu)是同一個(gè)性質(zhì)的東西，還是偶極矩矯正后還需要進(jìn)行重構(gòu)？重構(gòu)是通過什么方式來實(shí)現(xiàn)的？ ④MS中在選擇終端原子時(shí)很難在top那一步就設(shè)置到想要的，但如果先把slab厚度設(shè)置足夠大，再手動(dòng)刪除會(huì)方便很多，但刪減后的slab厚度就不知道怎么看了？ 真空層需要調(diào)整的話可以通過rebuild crystal中的晶胞參數(shù)來設(shè)置，這樣應(yīng)該不會(huì)改變盒子中原子的相對(duì)位置吧？ 還有ms中可以只移動(dòng)盒子的位置，不移動(dòng)盒子中原子的位置，也就是我想調(diào)整一下盒子和胞中原子的相對(duì)位置，有這功能嗎？ 感激不盡 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 vasp 第一性原理 |
» 猜你喜歡
能源材料化學(xué)課題組招收碩士研究生8-10名
已經(jīng)有11人回復(fù)
-
求材料調(diào)劑
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
材料專碩英一數(shù)二306
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600材料與化工調(diào)劑 324分
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有12人回復(fù)
-
0703化學(xué) 305求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
0703化學(xué)調(diào)劑，求各位老師收留
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
271材料工程求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
281求調(diào)劑（0805）
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- 請(qǐng)教MS建表面slab模型在轉(zhuǎn)為POSCAR文件過程的若干問題
已經(jīng)有15人回復(fù)
- 表面結(jié)構(gòu)如何考慮磁性問題
已經(jīng)有8人回復(fù)
guaiguaizhxd
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 金幣: 2381.3
- 紅花: 11
- 帖子: 191
- 在線: 255.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1195834
- 注冊(cè): 2011-01-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體物理
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2015-09-29 20:56:20
xiewei娜: 金幣+5, ★有幫助 2015-09-30 09:20:07
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2015-09-29 20:56:20
xiewei娜: 金幣+5, ★有幫助 2015-09-30 09:20:07
|
1. 固定多少層，弛豫多少層建議看已發(fā)表文獻(xiàn)。自己測(cè)試的話，看層間距。不建議自己測(cè)試，費(fèi)時(shí)間。 2. 真空層我一般用14埃。一般來說16埃都足夠了。。。 3. 非對(duì)稱的slab表面能比較難處理，一般來說要切得使兩個(gè)端面一致，然后再算表面能除以二就可以了。 4. 其它的問題繞的沒看明白。。。 |
2樓2015-09-29 17:40:24
沖天飛龍
木蟲 (小有名氣)
- 1ST強(qiáng)帖: 2
- 應(yīng)助: 70 (初中生)
- 金幣: 1888.6
- 紅花: 9
- 帖子: 239
- 在線: 61.7小時(shí)
- 蟲號(hào): 1944534
- 注冊(cè): 2012-08-18
- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性 II ：電子結(jié)構(gòu)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
xiewei娜: 金幣+12, ★★★很有幫助, 說的很清楚，太棒了，感謝大神！ 2015-10-01 10:45:20
xiewei娜: 金幣+3, ★★★很有幫助 2015-10-04 21:23:24
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
xiewei娜: 金幣+12, ★★★很有幫助, 說的很清楚，太棒了，感謝大神！ 2015-10-01 10:45:20
xiewei娜: 金幣+3, ★★★很有幫助 2015-10-04 21:23:24
|
1.首先收斂性測(cè)試包括很多，可以測(cè)試真空厚度，也可以測(cè)試slab應(yīng)該多厚夠用，還可以測(cè)試slab中要固定多少層，這些都是各自獨(dú)立的測(cè)試。比如測(cè)真空厚度時(shí)候，只改變真空厚度，不弛豫，看總能量隨真空的改變；測(cè)固定多少層時(shí)，不改變真空厚度，只改變固定的層數(shù)，做結(jié)構(gòu)弛豫計(jì)算，看層間距和化學(xué)鍵長(zhǎng)度。不同的收斂性測(cè)試不要混在一起，要控制變量 2.構(gòu)建表面的化學(xué)計(jì)量比，比如構(gòu)建TiO2，一般希望構(gòu)建的slab里Ti和O是1:2，這樣有兩個(gè)好處，一是Ti和O直接電子轉(zhuǎn)移情況和bulk TiO2類似，能形成close shell電子結(jié)構(gòu)，體系比較穩(wěn)定，二是算表面能的時(shí)候比較方便，直接把總能減去N個(gè)TiO2的能量再除以二就好了。但有的表面比較特殊，就是比例和bulk的不同，這也是沒辦法的，這種情況表面能的定義需要引入化學(xué)勢(shì)的概念 3.表面重構(gòu)和dipole修正。首先，把上表面的原子移到下表面不算表面重構(gòu)，這種移動(dòng)只是構(gòu)建一個(gè)合理表面所必須做的步驟。Dipole修正也不是表面重構(gòu)，有些表面確實(shí)帶有極性，這時(shí)候需要dipole correction來修正total energy和electrical potential，大部分的模擬軟件也都有這個(gè)功能。所謂表面重構(gòu)是指表面的結(jié)構(gòu)和直接從bulk structure切出來的不一樣，可能會(huì)在表面添加原子，從而降低surface energy和surface stress，讓表面更穩(wěn)定。 4. 把top和thickness兩個(gè)參數(shù)一起調(diào)整，同時(shí)監(jiān)控property窗口里每種原子的個(gè)數(shù)，來構(gòu)建合適的slab，也要盡量讓表面的原子的dangling bonds數(shù)量盡可能少一點(diǎn)。 至于移動(dòng)盒子問題，是通過同時(shí)選中所有原子，讓這所有原子一起移到來實(shí)現(xiàn)的 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
鄭亞鵬6樓2015-09-30 21:28:57
guaiguaizhxd
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 金幣: 2381.3
- 紅花: 11
- 帖子: 191
- 在線: 255.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1195834
- 注冊(cè): 2011-01-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體物理
|
你知道vasp是以周期性結(jié)構(gòu)為單位做計(jì)算的。因此所謂的slab也是一個(gè)超大的胞帶著一個(gè)真空層罷了。如果此時(shí)slab不對(duì)稱，那么上下表面之間就會(huì)有電場(chǎng)。而靜電力本身又是一種長(zhǎng)程作用力，很大的真空層也很難衰減掉。因此在vasp中通過軟件引入一個(gè)偶極子去抵消這個(gè)實(shí)際不存在的靜電勢(shì)就可以了。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
9樓2015-10-03 11:07:17
3樓2015-09-30 09:24:41
guaiguaizhxd
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 金幣: 2381.3
- 紅花: 11
- 帖子: 191
- 在線: 255.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1195834
- 注冊(cè): 2011-01-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體物理
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
xiewei娜: 金幣+5, ★有幫助 2015-09-30 17:11:20
xiewei娜: 金幣+5, ★有幫助 2015-09-30 17:11:20
|
當(dāng)然要優(yōu)化，看層間距。 表面穩(wěn)不穩(wěn)定看表面形成能唄。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2015-09-30 13:17:31
|
表面能小于多少就算是穩(wěn)定的，有參考值嗎？ 還有偶極矩矯正和表面重構(gòu)是一回事嗎？我看文章有的提到把上表面的某些原子移動(dòng)到下表面來使上下表面電荷相等來矯正偶極矩，這樣子算是一種重構(gòu)嗎，看文章的意思不算是重構(gòu)。 vasp中偶極矩矯正可以通過設(shè)置參數(shù)來實(shí)現(xiàn)，如上面所說的，文章中把上表面的某些原子移動(dòng)到下表面來使上下表面電荷相等來矯正偶極矩，所以我不太明白這個(gè)矯正偶極矩是通過設(shè)置LDIPOL= .TRUE. ；IDIPOL = 3 ，和通過手動(dòng)分配上下表面的某些原子，這兩種方法都可以，還是既要設(shè)置參數(shù)，同時(shí)要重新分配原子？  |
5樓2015-09-30 17:11:08
guaiguaizhxd
木蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 18 (小學(xué)生)
- 金幣: 2381.3
- 紅花: 11
- 帖子: 191
- 在線: 255.1小時(shí)
- 蟲號(hào): 1195834
- 注冊(cè): 2011-01-25
- 性別: GG
- 專業(yè): 半導(dǎo)體物理
【答案】應(yīng)助回帖
|
表面能當(dāng)然越負(fù)越穩(wěn)定了。偶極矯正是為了在上下面不對(duì)稱的時(shí)候，抵消不對(duì)稱帶來的電場(chǎng)，從而得到更準(zhǔn)確的結(jié)果。如果上下面是對(duì)稱的，當(dāng)然不要偶極矯正了。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
7樓2015-10-02 10:34:02
8樓2015-10-03 00:07:42
10樓2015-10-03 13:53:42
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 xiewei娜 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 0703化學(xué) 305求調(diào)劑 +4 | FY_yy 2026-03-14 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +5 | 陽(yáng)陽(yáng)哇塞 2026-03-14 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 297求調(diào)劑 +8 | 戲精丹丹丹 2026-03-17 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | 冷笙123 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)] 被我言中：新模板不強(qiáng)調(diào)格式了，假專家開始管格式了 +4 | beefly 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研求調(diào)劑 +3 | 橘頌. 2026-03-17 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 268求調(diào)劑 +8 | 一定有學(xué)上- 2026-03-14 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 有沒有道鐵/土木的想調(diào)劑南林，給自己招師弟中～ +3 | TqlXswl 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +6 | 孔志浩 2026-03-12 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +4 | ahbd 2026-03-14 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +6 | 太想進(jìn)步了0608 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +6 | ytter 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0703 物理化學(xué)調(diào)劑 +3 | 我可以上岸的對(duì)?/a> 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研]
 機(jī)械專碩調(diào)劑
+3
|
笨笨兔子 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 26考研一志愿中國(guó)石油大學(xué)(華東)305分求調(diào)劑 +3 | 嘉年新程 2026-03-15 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 22408總分284求調(diào)劑 +3 | InAspic 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料與化工 323 英一+數(shù)二+物化，一志愿：哈工大 本人本科雙一流 +4 | 自由的_飛翔 2026-03-13 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 招收0805（材料）調(diào)劑 +3 | 18595523086 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[論文投稿]
投稿問題
 5+4
|
星光燦爛xt 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 152697 2026-03-12 | 4/200 |
|