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夢黎科研金蟲 (小有名氣)
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[求助]
怎樣查找一個屬的特有序列呢?求教高手! 已有2人參與
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在做假單胞菌屬的分析,需要查找到假單胞菌屬的特有基因序列,但是無從下手。 已在Goog學術(shù),幾web of science查過相關文章,大部分只是敘述了相關蛋白或功能基因,一來沒有公開序列,二來也沒有說明是否是該屬特有的。 頭疼中…… 等待高手。 |
【資源-分享】 |
金蟲 (小有名氣)
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這位chen大哥所講有操作步驟,我想問一下,假單胞菌屬基因好處理,但是如何把它和其他物種區(qū)分開呢?其他物種是隨便選一些還是怎么處理呢……? 另外,最終是想把它和其他物種的全序列分開,只用blast只查到其他物種的16S序列。我想問,16S序列是物種基因里最保守的部分,一個物種的16S會與其他物種全基因組中的某段序列相同嗎? 我想和自己的全基因組不太會,但是和其他物種應該會的。這種情況下,要達到原來的目的,處理思路是怎樣的呢? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
金蟲 (小有名氣)
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