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怎樣從盒子中取出一個分子和離該分子最近的幾個溶劑分子
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| 大家好,我有一個盒子里面有一個溶質分子, 被溶劑分子包圍,用gromacs模擬.現(xiàn)在我想從得到的md軌跡當中每隔一段時間就把溶質分子和與他相鄰的幾個溶劑分子提取出來做一個量化計算, 請問這個可以用gromacs和vmd之類的軟件實現(xiàn)嘛? 具體應該怎么做?謝謝! |
新蟲 (小有名氣)
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