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怎樣從盒子中取出一個(gè)分子和離該分子最近的幾個(gè)溶劑分子
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| 大家好，我有一個(gè)盒子里面有一個(gè)溶質(zhì)分子， 被溶劑分子包圍，用gromacs模擬.現(xiàn)在我想從得到的md軌跡當(dāng)中每隔一段時(shí)間就把溶質(zhì)分子和與他相鄰的幾個(gè)溶劑分子提取出來做一個(gè)量化計(jì)算, 請(qǐng)問這個(gè)可以用gromacs和vmd之類的軟件實(shí)現(xiàn)嘛? 具體應(yīng)該怎么做？謝謝！ |
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2樓2021-11-02 10:41:20
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