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miRNA

至尊木蟲 (職業(yè)作家)

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專業(yè): 金屬有機化學(xué)

★
BlueGuy(金幣+1):謝謝！

序列開放閱讀框（ORF）查找和翻譯工具:

★ORF Finder
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
Finds likely open reading frames in a sequence.

★Nucleotide to Protein (Expasy)
5-2-1-DUW/Switzerland
http://www.expasy.ch/www/dna.html
Translates a nucleotide sequence (DNA/RNA) into a protein sequence (amino acids).

★Nucleotide to Protein (EMBL)
5-4-1-DUW/UK
http://www.ebi.ac.uk/contrib/tommaso/translate.html
Translates a nucleotide sequence into a protein sequence.

★Forward and Reverse Translation
5-5-2-DUPUFWE/UK
http://www.sanger.ac.uk/Software/Wise2/genewiseform.shtml
Translate a protein sequence into a genomic DNA sequence, and vice versa.

★Protein and cDNA Translation
5-4-2-DcUPU/UK
http://www.sanger.ac.uk/Software/Wise2/protein2cdna.shtml
Translate a protein sequence into a cDNA sequence, and vice versa.

蛋白質(zhì)分析工具:

★Web Cutter - Restriction Enzyme Mapping Utility
http://www.medkem.gu.se/cutter/default.htm
Map restriction enzyme sites on your sequence. Easy to use and comprehensive options.

★Protein Colourer
5-2-1-PUW/UK
http://www.ebi.ac.uk/htbin/visprot.pl
Colour a protein sequence (raw text or SWISS-PROT Acc. No.) by properties e.g. hydrophobicity.

★Residue Periodicity
Review this site
http://o2.dbuoa.gr/FT/default.htm
Study the periodicity of residues in a protein sequence.

★Compute the Theoretical pI and Mr
5-1-2-PUW/Switzerland
http://www.expasy.ch/ch2d/pi_tool.html
Calculates the theoretical pI or molecular mass of a protein, whose sequence is entered by the user, or referred to as a SWISS-PROT or TrEMBL entry.

★Random Protein Sequence Generator
5-5-2-PUW/Switzerland
http://www.expasy.ch/sprot/randseq.html
Random protein sequence generator! Output in FASTA format (the format most commonly required by bioinformatics search sites).

PCR 引物和探針數(shù)據(jù)庫:

★Primer 3
5-5-2-DUW/Norway
http://www2.no.embnet.uio.org/primer/primer3.cgi@
Select PCR primers for your nucleotide sequence.

★HGMP-RC Primers Database
http://www.hgmp.mrc.ac.uk/local-data/Primers.html

★EBI Primers Database
http://www.ebi.ac.uk/primers_home.html

★    Molecular Probe Data Base (MPDB or MOLPROBE)
http://www.biotech.ist.unige.it/interlab/mpdb.html

★    The Primer Generator :
http://www.med.jhu.edu/medcenter/primer/primer.cgi
以上資源來自中國生命科學(xué)論壇�。。。�

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cicfeiyu

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★ ★ ★
BlueGuy(金幣+3):歡迎歡迎！記得常來！

Very good!我還在納悶?zāi)兀趺葱∧鞠x沒有建立生物信息學(xué)板塊！希望能和你們多交流！��！

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22樓2005-06-07 22:18:34

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njyyy

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★ ★ ★
BlueGuy(金幣+3):呵呵，有好的主題可以合作！

支持一個

要強強聯(lián)合了，有魄力！認(rèn)真學(xué)習(xí)中.................................................................

是不是考慮什么時候和經(jīng)濟版也聯(lián)合一個

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23樓2005-06-07 22:27:59

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miRNA

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生物信息學(xué)多媒體課件PPT！��！

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BlueGuy(金幣+10):好東西！

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24樓2005-06-07 22:52:12

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hcooh

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很好！我學(xué)化學(xué)的，生物化學(xué)一家親哈！

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26樓2005-06-07 23:31:54

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傻小蟲

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★
BlueGuy(金幣+1):歡迎常來！

呵，有這么多的資料��！還有不少基因方面的高手呢，太好了。偶對這些知識向來是有興趣的，以后一定經(jīng)常來看看、學(xué)學(xué)，有問題我要來請教的。

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茍富貴,無相忘,等咱金幣多了也不發(fā)限制貼

27樓2005-06-07 23:38:36

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night2004

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不錯的東西，看得好累。支持一下

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從來沒有留給你任何位置---在我的心里。其實我生命中一直有座電影院，放映著我的心情，我的夢，我的渴望。擁有入場券的人，有的是我的親人，我的朋友，或者陌生

28樓2005-06-08 00:58:34

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華中農(nóng)業(yè)大學(xué)《生物信息學(xué)》講義.pdf

★ ★ ★
BlueGuy(金幣+3):謝謝分享！

生物信息學(xué)
王石平
(華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院)

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29樓2005-06-08 08:27:42

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生物信息學(xué)（中譯本）

★ ★ ★ ★
BlueGuy(金幣+4):好書！

序言　

過去十年中，全世界的分子生物學(xué)家們所收集的原始信息不斷激增。在不太久之前，這些信息的分析整理工作只有不情愿的研究生去做，因為他們對擺弄試管比敲擊鍵盤更有興趣，而現(xiàn)在有很多人已全身心地投入了這個領(lǐng)域。生物信息學(xué)正處于新興萌芽中，它可以不嚴(yán)格地定義為分子生物學(xué)和計算生物學(xué)的交叉，這個領(lǐng)域中已經(jīng)產(chǎn)生了大量重要的發(fā)現(xiàn)，并有希望揭示更多大自然的奧秘。對大多數(shù)人而言，生物信息學(xué)的吸引力在于它是生物學(xué)中嶄新和有待開墾的領(lǐng)域；而對其他人，其吸引力蘊藏在簡化論者對化學(xué)層次上的細(xì)節(jié)的熱愛和系統(tǒng)遺傳學(xué)家對了解各物種體系之間內(nèi)在關(guān)系的興趣之中。

生物信息學(xué)的好處早已作為談資得以廣泛宣揚，它被宣稱是能解決一切痼疾的仙丹，或是肢解序列數(shù)據(jù)的強大工具，或簡稱之為搞科學(xué)一條迷人途徑。而實際上，生物信息學(xué)是在艱難而有意義工作中的一種新的方法。這一領(lǐng)域中，研究方法大多在不斷變化并有待發(fā)展和完善，與當(dāng)年生物化學(xué)的黃金年代并無不同，那時人們選擇各種能溶解和分析目標(biāo)分子的手段，不象如今生化實驗室中所用技術(shù)要成熟和精巧得多。然而，在生物信息學(xué)被推向前進的競賽中，一些人曾企圖將其從科學(xué)分支降級為購買了合適工具包就完成的功能。而維護了生物信息學(xué)在科學(xué)領(lǐng)域中地位的正是學(xué)術(shù)用戶群體本身，無論他們是在私立大學(xué)里還是在政府贊助的研究中心里。生物信息學(xué)中已取得的卓越進展就蘊藏在從收集整理原始數(shù)據(jù)，到開發(fā)更新更強的數(shù)據(jù)處理方法的工作之中，而且一切均處于信息和技術(shù)自由共享的環(huán)境里。生物信息學(xué)群體的獨特之處在于，在商業(yè)部門之外，其“團體精神”比生物學(xué)中許多競爭性領(lǐng)域要開放得多。由此想法，本書試圖能讓那些想了解更多序列分析方法的科學(xué)家跳進書中，來體驗令人著迷的科學(xué)旅途。通過這本書，我們希望讀者能認(rèn)識到這些方法的嚴(yán)格性，并且明白，與實驗并無不同，控制器的運轉(zhuǎn)和弄清哪種方法能解決或不能解決何種問題，是至關(guān)重要的。總之，我們鼓勵讀者不妨一試。

這里，我們要共同感謝許多同仁，若非他們的幫助本書就難以實現(xiàn)。首先要感謝的是分別完成此書各章節(jié)的諸位作者。他們專業(yè)的見解與專家的觀點，以及他們在巨大時間壓力下仍友善地配合，使我們感到與這些女士和先生們一同合作十分愉快。

本書中極大部分內(nèi)容均得益于在NIH的國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）所開發(fā)的工具和數(shù)據(jù)庫，我們要感謝NCBI的全體成員，為他們辛勤的工作，也為了他們耐心負(fù)責(zé)地維護著這些公共數(shù)據(jù)庫，更重要的是為他們使這些數(shù)據(jù)庫具有最高的質(zhì)量和更方便地被科學(xué)工作者們訪問。那些從事計算生物學(xué)的科學(xué)家們一貫對他們的成果十分慷慨，制作了自由訪問的工具和專門數(shù)據(jù)庫。否則，連最基本的序列分析研究也是無法做到的。我們要感謝參與這些項目的所有成員，包括這里未曾特別提及的，因為是他們造就了這個以序列為基礎(chǔ)的新生物學(xué)時代的許多輝煌成就。

我們還要感謝本書編輯Ann Boyle的耐心幫助、鼓勵和支持。這本書也包含了我們的很多第一次，因而在學(xué)習(xí)出書的里里外外過程中，我們與她建立起了深厚的友誼。我們期待著未來能與她的再次合作。

以下來自BFFO：我要向一貫支持、熱愛和信任我的妻子Nancy Ryder致謝。她對這項工作的尊重，以及她給予了我這項工作所需的空間已超越了任何誓言，我只有以更多的愛作為回報。我還要感謝Mark Boguski在四年前將我介紹至NCBI。Mark還不斷引導(dǎo)我留意各種新鮮有趣的項目，這種持續(xù)的熱情和興趣將不斷賦予我更多靈感。

以下來自ADB：我誠意地感激David Landsman的極大支持和鼓勵。我與David的交情已有多年，那時他作為一個物理化學(xué)家接受作博士后，而當(dāng)時他對一門稱為生物信息學(xué)的領(lǐng)域幾乎一無所知。我認(rèn)為1992年的我們都無法猜到我們在教學(xué)和研究中的合作會最后會導(dǎo)致一本專著的產(chǎn)生。如果不是他在如何認(rèn)識計算生物學(xué)的問題上，更加強調(diào)了生物學(xué)對我產(chǎn)生了強烈影響，就不會有這本書。

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30樓2005-06-08 09:38:36

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