| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 698 | 回復(fù): 3 | |||
趙奇一新蟲 (小有名氣)
|
[求助]
請(qǐng)教一下關(guān)于siesta優(yōu)化層狀體系的問題 已有2人參與
|
| 我建好了一個(gè)由兩層原子構(gòu)成的體系,想進(jìn)行弛豫。希望在弛豫過程中,只發(fā)生兩層原子間距的變化,而每層原子的相對(duì)位置不變,也就是說所有原子只在Z方向上坐標(biāo)發(fā)生變化。這個(gè)如何實(shí)現(xiàn)?看了手冊(cè)感覺還是不太明白,希望大神能夠解答一下,謝謝了... |

木蟲 (小有名氣)
|
使用zmatrix可以進(jìn)行設(shè)置,詳見其例子 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
新蟲 (小有名氣)

木蟲 (著名寫手)
|
%block Zmatrix cartesian 1 -3.438229 6.506952 8.241026 0 0 0 1 2.329288 6.506952 8.241026 0 0 0 1 8.096804 1.512136 8.241026 0 0 0 1 6.654925 4.009544 8.241026 0 0 0 1 2.329288 1.512136 8.241026 0 0 0 1 -0.554470 6.506952 8.241026 0 0 0 1 5.213046 6.506952 8.241026 0 0 0 1 0.887409 9.004360 8.241026 0 0 0 1 -1.996350 9.004360 8.241026 0 0 0 1 -4.880108 9.004360 8.241026 0 0 0 1 -0.554470 1.512136 8.241026 0 0 0 1 5.213046 1.512136 8.241026 0 0 0 1 3.771167 9.004360 8.241026 0 0 0 1 -1.996350 4.009544 8.241026 0 0 0 1 3.771167 4.009544 8.241026 0 0 0 1 0.887409 4.009544 8.241026 0 0 0 2 -1.351749 6.858092 z1 0 0 1 2 -2.793628 9.355500 z1 0 0 1 2 4.415768 1.863277 z1 0 0 1 2 5.857647 9.355500 z1 0 0 1 2 2.973889 4.360684 z1 0 0 1 2 1.532010 6.858092 z1 0 0 1 2 7.299526 6.858092 z1 0 0 1 2 0.090131 9.355500 z1 0 0 1 2 7.299526 1.863277 z1 0 0 1 2 2.973889 9.355500 z1 0 0 1 2 5.857647 4.360684 z1 0 0 1 2 8.741405 4.360684 z1 0 0 1 2 4.415768 6.858092 z1 0 0 1 2 1.532010 1.863277 z1 0 0 1 2 10.183280 1.863277 z1 0 0 1 2 0.090131 4.360684 z1 0 0 1 variables z1 37.271882 %endblock Zmatrix 上面這個(gè)zmatrix的示例就可以將兩層(分別是1號(hào)原子和2號(hào)原子組成)的x,y坐標(biāo)固定,在優(yōu)化中只允許第二層的原子整體沿著z方向移動(dòng)。第二層原子的z坐標(biāo)的初值是37.271882 這樣做的前提是這個(gè)雙層結(jié)構(gòu)平面要在xy平面內(nèi),兩層間的距離在z方向上。 |

| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 求調(diào)劑 +5 | 研研,接電話 2026-03-24 | 6/300 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +3 | desto 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
[基金申請(qǐng)] 請(qǐng)教下大家 2026年國(guó)家基金申請(qǐng)是雙盲審嗎? +3 | lishucheng1 2026-03-22 | 5/250 |
|
|
[考研] 384求調(diào)劑 +3 | 子系博 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +5 | 安憶靈 2026-03-22 | 6/300 |
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 13341 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 0703化學(xué)297求調(diào)劑 +3 | Daisy☆ 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +5 | shxchem 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +3 | 鳳凰院丁真 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 303求調(diào)劑 +5 | 睿08 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
[考研] 083200學(xué)碩321分一志愿暨南大學(xué)求調(diào)劑 +3 | innocenceF 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ,070300化學(xué)學(xué)碩,總分287,雙非一本,求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
[考研] 中南大學(xué)化學(xué)學(xué)碩337求調(diào)劑 +3 | niko- 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿南京航空航天大學(xué)289分 +3 | @taotao 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
[考研] 353求調(diào)劑 +3 | 拉鉤不許變 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
[考研] 086500 325 求調(diào)劑 +3 | 領(lǐng)帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
[考研] 0856調(diào)劑,是學(xué)校就去 +8 | sllhht 2026-03-19 | 9/450 |
|
|
[考研] 085410人工智能專碩317求調(diào)劑(0854都可以) +4 | xbxudjdn 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
[考研] 一志愿中國(guó)海洋大學(xué),生物學(xué),301分,求調(diào)劑 +5 | 1孫悟空 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
[考研] 085600材料與化工調(diào)劑 324分 +10 | llllkkkhh 2026-03-18 | 12/600 |
|