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hshhqu3新蟲(chóng) (小有名氣)
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請(qǐng)各位學(xué)長(zhǎng)學(xué)姐，老師，專家等指點(diǎn)一下。非常感謝啊 1.NCBI基因組序列提交時(shí)，能提交包含 scaffolds 的序列文件嗎？ 測(cè)序公司給的基因組測(cè)序結(jié)果文件里（fna格式），含有幾十個(gè)contigs 和十幾個(gè)scaffolds.文件較大，我自己無(wú)法把contigs和 scaffolds分開(kāi)。所以，提交序列時(shí)，能將contigs 和 scaffolds 一并提交嗎？ 2.能用什么方法來(lái)判定contigs里面有多少個(gè)chromosomes 和幾個(gè)plasmids？ |
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2樓2015-11-12 19:00:35
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我傳個(gè)文件給你看看哈。一個(gè)文件里不但有很多contigs，還有很多scaffolds. 怎么分離開(kāi)啊。求指點(diǎn)啊。能將所有的contig是 序列提取出來(lái)嗎？文件有幾千頁(yè)，手工是沒(méi)法提取出contigs 序列的。 謝謝 |
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2015-11-13 09:43:48, 5.61 M
3樓2015-11-13 09:43:50
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4樓2015-11-13 11:07:19
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