版塊導(dǎo)航: 正在加載中...

應(yīng)《網(wǎng)絡(luò)安全法》要求，自2017年10月1日起，未進(jìn)行實(shí)名認(rèn)證將不得使用互聯(lián)網(wǎng)跟帖服務(wù)。為保障您的帳號(hào)能夠正常使用，請(qǐng)盡快對(duì)帳號(hào)進(jìn)行手機(jī)號(hào)驗(yàn)證，感謝您的理解與支持！

24小時(shí)熱門(mén)版塊排行榜

北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

返回列表

當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖

雨思瑤

管理員

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 530
散金: 50
紅花: 1
帖子: 64
在線: 42.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 3084963
注冊(cè): 2014-03-24

[求助] 關(guān)于用高斯進(jìn)行二面角扭轉(zhuǎn)勢(shì)能的計(jì)算已有1人參與

目前剛剛接觸高斯，有很多東西不懂還請(qǐng)大神們多多幫助！想通過(guò)高斯得到二面角扭轉(zhuǎn)項(xiàng)的參數(shù) 現(xiàn)有一些問(wèn)題希望得到大家的指點(diǎn)！
————————————————————————————————————————————————————————————————————————————
問(wèn)題一：
改變分子的某個(gè)二面角進(jìn)行勢(shì)能面掃描，得到的勢(shì)能是整個(gè)分子所具有的能量還是二面角扭轉(zhuǎn)能呀如果不是，那我該怎樣得到二面角扭轉(zhuǎn)能呀？
————————————————————————————————————————————————————————————————————————————
問(wèn)題一：
1.以優(yōu)化后的構(gòu)型（圖1）進(jìn)行scan 輸入文件如下：
%chk=butenal scan4.chk
# scan mp2/6-31g(d,p)

butenal scan4

0 1
C
H                1          B1
H                1          B2 2          A1
H                1          B3 3          A2 2          D1 0
C                1          B4 3          A3 2          D2 0
C                5          B5 1          A4 3          D3 0
H                6          B6 5          A5 1          D4 0
C                6          B7 5          A6 1          D5 0
H                5          B8 1          A7 6          D6 0
O                8          B9 6          A8 5          D7 0
H                8          B10 6          A9 5          D8 0

B1          1.09098656
B2          1.08851522
B3          1.09094809
B4          1.49214883
B5          1.34335747
B6          1.08420808
B7          1.47715825
B8          1.08560982
B9          1.22858510
B10          1.10404410
A1          108.52928043
A2          108.53343303
A3          111.55379702
A4          125.03776157
A5          121.24817021
A6          121.03055676
A7          117.87920670
A8          124.24945530
A9          115.54645890
D1       -115.78660028
D2          122.10468426
D3          0.02253979
D4          0.02458913
D5       -179.97564359
D6       -179.98071445
D7          -180.00000000             180             2.000
D8          0.00000000
但是在掃描過(guò)程中原子11和10連在一起了，見(jiàn)圖2
然后我進(jìn)行了如下修改即定義原子11時(shí)使用的是兩個(gè)鍵角來(lái)確定其空間位置，而非一個(gè)鍵角一個(gè)二面角目的是為了固定原子8 10 10組成的鍵角以免在二面角改變的時(shí)候11和10連在一起了。手冊(cè)上關(guān)于這部分“另一種z-矩陣格式”里面有提到，但是沒(méi)有看明白。
我是這樣修改的，
0 1
C
H                1          B1
H                1          B2 2          A1
H                1          B3 3          A2 2          D1 0
C                1          B4 3          A3 2          D2 0
C                5          B5 1          A4 3          D3 0
H                6          B6 5          A5 1          D4 0
C                6          B7 5          A6 1          D5 0
H                5          B8 1          A7 6          D6 0
O                8          B9 6          A8 5          D7 0
H                8          B10 6          A9 10          A10 1
但是用view無(wú)法打開(kāi)，提示幾何構(gòu)型錯(cuò)誤（見(jiàn)圖3）。我想可能是我這里的修改不正確，不知道該怎樣修改呀。希望高手能教教我

—————————————————————————————————————————————————————————————————————————--------—

問(wèn)題完

關(guān)于用高斯進(jìn)行二面角扭轉(zhuǎn)勢(shì)能的計(jì)算

丁烯醛優(yōu)化構(gòu)型

關(guān)于用高斯進(jìn)行二面角扭轉(zhuǎn)勢(shì)能的計(jì)算-1

掃描過(guò)程中10與11連在一起了

關(guān)于用高斯進(jìn)行二面角扭轉(zhuǎn)勢(shì)能的計(jì)算-2

提示的錯(cuò)誤

回復(fù)此樓

» 收錄本帖的淘帖專輯推薦

量子化學(xué)

» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）

雨思瑤

» 猜你喜歡

求標(biāo)準(zhǔn)卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340 已經(jīng)有2人回復(fù)
量子點(diǎn)電致發(fā)光器件（QLED）：藍(lán)光量子點(diǎn)（QDs）和納米氧化鋅電子傳輸材料已經(jīng)有0人回復(fù)
物理化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)? 已經(jīng)有171人回復(fù)
七嗪類物質(zhì)合成求助已經(jīng)有0人回復(fù)
需要一個(gè)圓偏振光誘導(dǎo)化學(xué)反應(yīng)，請(qǐng)問(wèn)使用圓偏振光作為光源，應(yīng)該需要哪些設(shè)備搭建已經(jīng)有0人回復(fù)
分子動(dòng)力學(xué)模擬合作需求已經(jīng)有3人回復(fù)
求ENDNOTE破解軟件安裝包已經(jīng)有4人回復(fù)
河海大學(xué) （211.雙一流高校）鈣鈦礦光電實(shí)驗(yàn)室丁勇團(tuán)隊(duì)歡迎有志青年！已經(jīng)有3人回復(fù)
黑龍江省原子能研究院化學(xué)課題組招收2026級(jí)化學(xué)專業(yè)或化學(xué)相關(guān)專業(yè)碩士生已經(jīng)有0人回復(fù)
26博士申請(qǐng) 已經(jīng)有0人回復(fù)

» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)

1樓 2015-11-12 10:25:52

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

雨思瑤

主管區(qū)長(zhǎng)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 530
散金: 50
紅花: 1
帖子: 64
在線: 42.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 3084963
注冊(cè): 2014-03-24

引用回帖:

6樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2015-11-13 07:06:27
關(guān)鍵是6 8 10 11這4個(gè)點(diǎn)共平面的話，以8為中心，6 8 10,10 8 11,11 8 6，這3個(gè)角的和不能大于360啊...

謝謝您的解釋不過(guò)我現(xiàn)在又遇到了新的問(wèn)題計(jì)算分子中某個(gè)原子與一個(gè)氖原子之間的相互作用能用高斯怎么實(shí)現(xiàn)呀目的是為了通過(guò)擬合得到LJ勢(shì)能方程中的非鍵作用參數(shù)（井深和原子半徑）看到別人有用scan的但是不知道如何確定氖原子與另外一個(gè)原子的空間位置

發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端

贊一下

回復(fù)此樓

7樓2015-11-13 12:19:14

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

查看全部 7 個(gè)回答

槍下游魂

版主

應(yīng)助: 718 (博后)
金幣: 8336.9
散金: 175
紅花: 80
帖子: 1498
在線: 542.6小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 2620258
注冊(cè): 2013-08-28
專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1

1、算的是整體能量。不懂什么是二面角扭轉(zhuǎn)能，與初始結(jié)構(gòu)的能量差么？
2、A10的值設(shè)的多少？11,10,8,6這4個(gè)原子在同一平面內(nèi)，所以11,8,10這個(gè)角不能大于120

贊一下

回復(fù)此樓

» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）

雨思瑤

2樓2015-11-12 11:41:43

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

雨思瑤

管理員

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 530
散金: 50
紅花: 1
帖子: 64
在線: 42.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 3084963
注冊(cè): 2014-03-24

送紅花一朵

謝謝您的回復(fù) 11 8 10組成的鍵角優(yōu)化后的鍵角是120.24053 所以我是這樣設(shè)置的按照您的方式修改成120之后用view可以打開(kāi)了但是不明白為何5 6 8 10在一個(gè)平面的話角度不能超過(guò)120度呀

發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端

贊一下

回復(fù)此樓

3樓2015-11-12 19:51:58

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

雨思瑤

實(shí)習(xí)版主

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 530
散金: 50
紅花: 1
帖子: 64
在線: 42.4小時(shí)
蟲(chóng)號(hào): 3084963
注冊(cè): 2014-03-24

送紅花一朵

引用回帖:

2樓: Originally posted by 槍下游魂 at 2015-11-12 11:41:43
1、算的是整體能量。不懂什么是二面角扭轉(zhuǎn)能，與初始結(jié)構(gòu)的能量差么？
2、A10的值設(shè)的多少？11,10,8,6這4個(gè)原子在同一平面內(nèi)，所以11,8,10這個(gè)角不能大于120

謝謝您的回復(fù) 11 8 10組成的鍵角優(yōu)化后的鍵角是120.24053 所以我是這樣設(shè)置的按照您的方式修改成120之后用view可以打開(kāi)了但是不明白為何5 6 8 10在一個(gè)平面的話角度不能超過(guò)120度呀

贊一下

回復(fù)此樓

4樓2015-11-12 19:53:37

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

查看全部 7 個(gè)回答

普通表情龍兔虎貓

最具人氣熱帖推薦 [查看全部]		作者	回/看	最后發(fā)表

[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +7	hanamiko 2026-03-30	7/350	2026-04-01 13:22 by JourneyLucky
[考研] 一志愿北交材料工程總分358 +5	cs0106 2026-04-01	7/350	2026-04-01 11:45 by wangjy2002
[考研] 生物與醫(yī)藥考研調(diào)劑 +3	鐵憨憨123425 2026-03-31	3/150	2026-04-01 10:53 by judy105
[考研] 材料0856 英一數(shù)二 323 求調(diào)劑 +8	袁sy 2026-04-01	8/400	2026-04-01 10:11 by 唐沐兒
[考研] 一志愿天津大學(xué)339材料與化工求調(diào)劑 +4	江往賣魚(yú) 2026-03-26	4/200	2026-04-01 09:25 by oooqiao
[考研] 349求調(diào)劑 +6	zwjjjjjj 2026-03-31	6/300	2026-04-01 09:16 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西交大080500材料學(xué)碩349 +6	jqx1258 2026-03-31	7/350	2026-03-31 21:08 by yuq
[考研] 材料科學(xué)與工程求調(diào)劑 +13	深V宿舍吧 2026-03-29	13/650	2026-03-31 19:50 by Dyhoer
[考研] 285求調(diào)劑 +3	FZAC123 2026-03-30	3/150	2026-03-31 17:49 by 熱情沙漠
[考研] 一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。 +12	nnnnnnn5 2026-03-25	12/600	2026-03-31 16:21 by 記事本2026
[考研] 吉大生物學(xué)326分求調(diào)劑 +3	sunnyupup 2026-03-31	3/150	2026-03-31 09:28 by longlotian
[考研] 福建理工大學(xué)材料學(xué)院先進(jìn)合金團(tuán)隊(duì)招收考研調(diào)劑學(xué)生 +3	大華金商都 2026-03-30	4/200	2026-03-31 01:04 by 方英俊602
[考研] 279求調(diào)劑 +12	j的立方 2026-03-29	12/600	2026-03-30 20:30 by dick_runner
[有機(jī)交流] 考研調(diào)劑 +8	watb 2026-03-26	8/400	2026-03-30 18:40 by 544594351
[考研] 328求調(diào)劑 +8	嗯滴的基本都 2026-03-27	8/400	2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 329求調(diào)劑 +8	星野? 2026-03-26	8/400	2026-03-30 13:41 by chemdavid
[考研] 085602 化學(xué)工程專碩 340分求調(diào)劑 +4	qianbai11 2026-03-29	4/200	2026-03-30 11:34 by 唐沐兒
[考研] 08開(kāi)頭275求調(diào)劑 +4	拉誰(shuí)不重要 2026-03-26	4/200	2026-03-27 14:12 by Delta2012
[考研] 305求調(diào)劑 +5	哇盧卡庫(kù) 2026-03-26	5/250	2026-03-27 14:01 by laoshidan
[考研] 0703化學(xué)338求調(diào)劑！ +6	Zuhui0306 2026-03-26	7/350	2026-03-27 10:35 by shangxh