 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2446 | 回復(fù): 3 | ||||
[交流]
分子生物實(shí)驗(yàn)室常用的小公式 已有3人參與
|
|
老師從小就教導(dǎo)我們：“先把數(shù)據(jù)算算對(duì)，再去做實(shí)驗(yàn)！還有，說的就是你啦，別忘了單位！”。不知道長(zhǎng)做分子生物實(shí)驗(yàn)的同學(xué)們有沒有這樣的感覺，計(jì)算其實(shí)是一個(gè)十分重要的過程，這關(guān)系到整個(gè)實(shí)驗(yàn)的成功與否。有時(shí)候要算個(gè)摩爾數(shù)啊，再來個(gè)摩爾比啊，最后再來個(gè)單位換算什么的，一堆一堆，絕對(duì)不難。 切入正題，到底哪些公式會(huì)比較常用呢？小編認(rèn)為有一下幾種： 1. 摩爾濃度（mol/L）與溶質(zhì)質(zhì)量（g） m (g) = Desired Molarity (mol/L) x V溶劑 (L) x M溶質(zhì) (g/mol) 2. 稀釋倍數(shù)n 和稀釋液的體積Vadding n =（Cfinal * Vfinal）/（Cstock * Vstock） Vadding = Vfinal – Vstock Final=最終溶液 Stock=儲(chǔ)備液/原液 3. 論OD260的重要性（當(dāng)實(shí)驗(yàn)室的Nanodrop壞掉了或被壞人持續(xù)占用了） CDNA/RNA (μg/ml) = Absorbance (OD260) * conversion factor conversion factors: 1 OD260 Unit = 50 μg/ml， dsDNA 1 OD260 Unit = 40 μg/ml， ssRNA 1 OD260 Unit = 33 μg/ml， ssDNA 這里的μg/ml也就是ng/μl，所以和Nanodrop測(cè)出來的單位是相同的。值得注意的是，這里的每一個(gè)OD260­單位對(duì)應(yīng)的核酸濃度只是估算值，畢竟堿基組成不同也會(huì)造成折光度的差異，所以在有的網(wǎng)站上，這三組值也會(huì)略有差異。 4. DNA/RNA 質(zhì)量到摩爾數(shù)的估測(cè)轉(zhuǎn)換 dsDNA: molesdsDNA (mol) = mdsDNA (g)/[(length of dsDNA (bp) x 617.96 g/mol) + 36.04 g/mol] ssDNA: molesssDNA (mol) = mssDNA (g)/[(length of ssDNA (nt) x 308.97 g/mol) + 18.02 g/mol] ssRNA: molesssRNA (mol) = mssRNA (g)/[(length of ssRNA (nt) x 321.47 g/mol) + 18.02 g/mol] 這里bp就是堿基對(duì)數(shù)，nt就是核苷酸數(shù)。 正常估算來講一對(duì)堿基的平均摩爾質(zhì)量是650 g/mol，小編這里用的是NEB （New England Biolad）推出的修正公式。617.96 g/mol 其實(shí)是除去了每對(duì)堿基兩端的水分子（聚合成鏈的過程是要除去一個(gè)H和一個(gè)OH的）。最后又加上36.04 g/mol，是假設(shè)兩個(gè)-OH和兩個(gè)-H分別加在最后大分子的兩端。這樣的算法比直接使用650 g/mol要稍微準(zhǔn)確一點(diǎn)，但是整個(gè)過程還是建立在估算堿基對(duì)平均分子量的基礎(chǔ)之上，所以不論哪種方法計(jì)算出來的都是平均值而已。 5. 粘合反應(yīng)（ligation）插入片段和質(zhì)粒的摩爾比例 Massinsert (g) = (insert/vector molar ratio) x massvector (g) x (ratio of insert/vector lengths) 一般這個(gè)插入片段對(duì)質(zhì)粒的摩爾比例可以是2:1或者是3:1，都可以根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)而定。另外一個(gè)重要的比例就是插入片段對(duì)質(zhì)粒的序列長(zhǎng)度比。 6. 單位換算 1 ng = 10-3 μg =10-6 mg = 10-9 g = 10-12 kg 1 cm3 = 10-3 dm3 = 10-6 m3 1 cm3 = 1 mL 1 dm3 = 1 L 等等等…… 要了解的運(yùn)算還很多，小編只是在這里寫了些做分子生物實(shí)驗(yàn)會(huì)用到的，還有其他很多，比如估算蛋白分子質(zhì)量，蛋白OD280的轉(zhuǎn)化因子等等。NEB有一個(gè)網(wǎng)頁版簡(jiǎn)單的BioCalculator，包含了上面所說的這些計(jì)算方法，用起來還是很方便的（http://nebiocalculator.neb.com/#!/）。 原文鏈接http://mp.weixin.qq.com/s?__biz= ... e=0#wechat_redirect BioEngX 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 蛋白表達(dá)純化鑒定精華 |
» 猜你喜歡
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：實(shí)驗(yàn)器材的 “烏龍”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)中的趣事：和實(shí)驗(yàn)材料的 “斗智斗勇”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
化學(xué)工程及工業(yè)化學(xué)論文潤(rùn)色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有157人回復(fù)
-
蛋白質(zhì)檢測(cè)：精準(zhǔn)分析，解鎖生物分子的密碼
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之小鼠實(shí)驗(yàn)：嚴(yán)謹(jǐn)設(shè)計(jì)，解析生命機(jī)制的重要載體
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之重金屬檢測(cè)：精準(zhǔn)篩查，守護(hù)健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“蛙測(cè)重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
不合理蛙科研實(shí)驗(yàn)之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標(biāo)南京
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
haocui
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1784.7
- 散金: 3585
- 紅花: 4
- 帖子: 823
- 在線: 305.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 649732
- 注冊(cè): 2008-11-09
- 性別: MM
- 專業(yè): 藥物學(xué)
2樓2016-02-18 16:25:00
CUISHENGRONG
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 601.2
- 帖子: 82
- 在線: 16.9小時(shí)
- 蟲號(hào): 4034498
- 注冊(cè): 2015-08-23
- 性別: MM
- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
3樓2017-09-23 09:11:42
1822215919
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 41.5
- 帖子: 19
- 在線: 5.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 8485472
- 注冊(cè): 2018-04-09
- 專業(yè): 敏感電子學(xué)與傳感器
4樓2018-12-07 12:55:25
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 tjuhaoran 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料專碩英一數(shù)二306 +4 | z1z2z3879 2026-03-18 | 4/200 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 311求調(diào)劑 +11 | 冬十三 2026-03-15 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑 +7 | 手機(jī)用戶 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | pupcoco 2026-03-17 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 工科材料085601 279求調(diào)劑 +6 | 困于星晨 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 278求調(diào)劑 +5 | 煙火先于春 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 上岸的小葡 2026-03-15 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 302求調(diào)劑 +4 | 小賈同學(xué)123 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
|
[考研]
 11408 一志愿西電，277分求調(diào)劑
+3
|
zhouzhen654 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +4 | 諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)覬?/a> 2026-03-15 | 7/350 |
|
|
|
[基金申請(qǐng)]
今年的國基金是打分制嗎？
 50+3
|
zhanghaozhu 2026-03-14 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 070300化學(xué)學(xué)碩求調(diào)劑 +6 | 太想進(jìn)步了0608 2026-03-16 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 085600調(diào)劑 +5 | 漾漾123sun 2026-03-12 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 0856專碩279求調(diào)劑 +5 | 加油加油！? 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 中科大材料專碩319求調(diào)劑 +3 | 孟鑫材料 2026-03-13 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 255求調(diào)劑 +3 | 李嘉慧， 2026-03-12 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 266求調(diào)劑 +4 | 學(xué)員97LZgn 2026-03-13 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 290求調(diào)劑 +7 | ADT 2026-03-12 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +3 | 程雨杭 2026-03-12 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料301分求調(diào)劑 +5 | Liyouyumairs 2026-03-12 | 5/250 |
|