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heihei2866鐵蟲 (正式寫手)
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[求助]
基因組測序結果提交NCBI的困惑 已有1人參與
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| 各位大神,本人前期委托公司對一個細菌的基因組進行了測序,想在genome announcement上發(fā)表一個小文章,但是前提是要公布基因組,在提交的過程中遇到了幾個問題,1. 是否需要在SRA提交原始數據?2. 我拿到的數據是拼接到scaffold的,論文里面也提到了scaffold,我現在只想提交contig,可以嗎?因為公司沒有提供AGP文件,我無法將contig和scaffold對應;3. 是否必須要提交基因組注釋文件,要是提供的話需要轉化成sqn嗎?怎么轉化?本人純外行一個,所以問題比較多,希望高手能提供幫助,不勝感激啊 |
鐵蟲 (正式寫手)
銀蟲 (初入文壇)

鐵蟲 (正式寫手)
木蟲 (小有名氣)
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我去年提交的部分全基因組序列。序列可以提交至ncbi,我采用的在線提交,未提交的原始序列,可以僅僅提交contig?梢圆蛔⑨尅 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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