zhy0512

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[交流] 對(duì)相關(guān)勢(shì)函數(shù)求原子受力

已知各原子的三維坐標(biāo)，對(duì)二體勢(shì)（例如Morse勢(shì)）求原子受力，可直接用勢(shì)函數(shù)對(duì)位移求導(dǎo)。但三體勢(shì)（例如鍵角能）如何求個(gè)原子受力？
查了好久文獻(xiàn)資料都沒找到相關(guān)內(nèi)容，還希望各位前輩指教。
若有相關(guān)的文獻(xiàn)和書籍，還望推薦。萬分感謝。

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1樓 2015-11-23 11:57:02

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jjlex

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cos(theta)=向量a.向量b/|ab|，鏈?zhǔn)角髮?dǎo)一直求到每個(gè)原子的xyz坐標(biāo)

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2樓2015-11-23 12:04:00

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向量a=向量i->j
向量b=向量i->k

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4樓2015-11-23 12:06:30

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zhuguiqiu

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23樓2015-11-23 12:39:16

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jerkwin

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這個(gè)的公式有點(diǎn)復(fù)雜, 你自己可以推導(dǎo)出來. 如果自己推導(dǎo)不出來, 你可以找些分子動(dòng)力學(xué)程序的源代碼看看, 里面會(huì)有相應(yīng)的計(jì)算代碼.

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zhy0512

24樓2015-11-24 00:34:38

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24樓: Originally posted by jerkwin at 2015-11-24 00:34:38
這個(gè)的公式有點(diǎn)復(fù)雜, 你自己可以推導(dǎo)出來. 如果自己推導(dǎo)不出來, 你可以找些分子動(dòng)力學(xué)程序的源代碼看看, 里面會(huì)有相應(yīng)的計(jì)算代碼.

謝謝。還想請(qǐng)教一下。
公式推導(dǎo)是將cos用余弦公式展開，然后再用鏈?zhǔn)角髮?dǎo)嗎？

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25樓2015-11-24 13:33:14

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引用回帖:

25樓: Originally posted by zhy0512 at 2015-11-24 13:33:14
謝謝。還想請(qǐng)教一下。
公式推導(dǎo)是將cos用余弦公式展開，然后再用鏈?zhǔn)角髮?dǎo)嗎？

...

仔細(xì)看看下面的注釋吧
!  i<---j--->k Tht = Ang(i j k)
!  E = E(Tht), Rji*Rjk*cosTht = Dot(rji, rjk) = Xi*Xk+Yi*Yk+Zi*Zk
!  Rjk*gradi[Rji*cosTht] = gradi[Xi*Xk+Yi*Yk+Zi*Zk]
!  cosTht*gradi[Rji]-Rji*sinTht*gradi[Tht] = ^rjk
! -Rji*sinTht*gradi[Tht] = ^rjk - cosTht ^rji
!  gradi[Tht] = -(^rjk - cosTht ^rji)/(Rji*sinTht)

!  Fi = -gradi E(Tht) = -{ dE/dXi, dE/dYi, dE/dZi }
!    = -dE/dTht gradi[Tht]
!    = dE/dTht (^rjk - cosTht ^rji)/(Rji*sinTht)
!  Fk = dE/dTht (^rji - cosTht ^rjk)/(Rjk*sinTht)
!  Fj = -Fi-Fk

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26樓2015-11-24 21:17:27

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syhorchid3樓

2015-11-23 12:05 回復(fù)

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dmbb5樓

2015-11-23 12:28 回復(fù)

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liucheng8836樓

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hodydo7樓

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qfwvpg8樓

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。

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