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sunny11223鐵桿木蟲 (著名寫手)
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[求助]
請教 MS（discover，forcite）與Lammps,DL_Poly，gromacs的區(qū)別 已有1人參與
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請問做分子動力學(xué)，MS中的discover，forcite與Lammps,DL_Poly，gromacs的主要區(qū)別在哪？各有什么優(yōu)勢？各自更適合什么樣子的動力學(xué)體系？目前從文章角度看，哪個計算出的結(jié)果更被認(rèn)可？ discover，forcite對比Lammps,DL_Poly，gromacs的話是不是認(rèn)可度低一些？目前實驗室用的是MS這方面，對于Lammps,DL_Poly，gromacs沒用過，考慮是否轉(zhuǎn)向這些動力學(xué)模擬。要選擇的話，Lammps,DL_Poly，gromacs，這三者選擇哪一個？  求大神幫助！ |
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 動力學(xué)模擬 |
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2樓2015-12-08 16:12:33
sunny11223
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3樓2015-12-08 19:46:54
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4樓2015-12-08 20:18:08
leisuredeng
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【答案】應(yīng)助回帖
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sunny11223: 金幣+5, ★★★很有幫助 2015-12-09 14:48:31
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這個問題太難回答...MS功能是很強(qiáng)大，建模計算都能做，但是是因為太過集成，很多東西你都是不用考慮就可以做，比較適合那些沒有編程基礎(chǔ)的人用。Lammps個人認(rèn)為目前除了帶電子系統(tǒng)不能做以外，基本上只要有勢函數(shù)都o(jì)k（淺見哈），能做的體系規(guī)模也比較大，分子動力學(xué)當(dāng)仁不讓的主力（嘿嘿，還是淺見）。電子系統(tǒng)還是用vasp，QE之類的第一性軟件吧。DLPOLY類似lammps，功能也強(qiáng)大，這兩個我用的比較多，感情挺深，哈哈。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
5樓2015-12-08 22:42:03
leisuredeng
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至于發(fā)文章，還是看你做什么了，個人感覺沒有實驗對比，純分子動力學(xué)很難發(fā)高影響因子的文章（依然是淺見）。除非你是開發(fā)勢函數(shù)，影響因子低，引用高...不過花的時間可能就很多了…… 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
6樓2015-12-08 22:53:41
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