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sunny11223鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
請(qǐng)教 MS(discover,forcite)與Lammps,DL_Poly,gromacs的區(qū)別 已有1人參與
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請(qǐng)問(wèn)做分子動(dòng)力學(xué),MS中的discover,forcite與Lammps,DL_Poly,gromacs的主要區(qū)別在哪?各有什么優(yōu)勢(shì)?各自更適合什么樣子的動(dòng)力學(xué)體系?目前從文章角度看,哪個(gè)計(jì)算出的結(jié)果更被認(rèn)可? discover,forcite對(duì)比Lammps,DL_Poly,gromacs的話是不是認(rèn)可度低一些?目前實(shí)驗(yàn)室用的是MS這方面,對(duì)于Lammps,DL_Poly,gromacs沒(méi)用過(guò),考慮是否轉(zhuǎn)向這些動(dòng)力學(xué)模擬。要選擇的話,Lammps,DL_Poly,gromacs,這三者選擇哪一個(gè)? ![]() 求大神幫助! |
動(dòng)力學(xué)模擬 |
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
銀蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)

銀蟲(chóng) (初入文壇)
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這個(gè)問(wèn)題太難回答...MS功能是很強(qiáng)大,建模計(jì)算都能做,但是是因?yàn)樘^(guò)集成,很多東西你都是不用考慮就可以做,比較適合那些沒(méi)有編程基礎(chǔ)的人用。Lammps個(gè)人認(rèn)為目前除了帶電子系統(tǒng)不能做以外,基本上只要有勢(shì)函數(shù)都o(jì)k(淺見(jiàn)哈),能做的體系規(guī)模也比較大,分子動(dòng)力學(xué)當(dāng)仁不讓的主力(嘿嘿,還是淺見(jiàn))。電子系統(tǒng)還是用vasp,QE之類的第一性軟件吧。DLPOLY類似lammps,功能也強(qiáng)大,這兩個(gè)我用的比較多,感情挺深,哈哈。 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
銀蟲(chóng) (初入文壇)
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至于發(fā)文章,還是看你做什么了,個(gè)人感覺(jué)沒(méi)有實(shí)驗(yàn)對(duì)比,純分子動(dòng)力學(xué)很難發(fā)高影響因子的文章(依然是淺見(jiàn))。除非你是開(kāi)發(fā)勢(shì)函數(shù),影響因子低,引用高...不過(guò)花的時(shí)間可能就很多了…… 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
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