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[交流]
求教vasp中的PBS腳本如何實(shí)現(xiàn)循環(huán)？ 已有4人參與
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比如我想實(shí)現(xiàn)以下的循環(huán)，用PBS腳本提交任務(wù)的話，應(yīng)該怎么編寫(xiě)？ 新人，沒(méi)金幣，不好意思了  #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 150 200 250 300 350 400 do cat > INCAR <<! SYSTEM = Si-Diamond ENCUT = $i ISTART = 0 ; ICHARG = 2 ISMEAR = -5 PREC = Accurate ! echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘ echo $i $E >>comment done |
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2樓2015-12-11 08:44:56
3樓2015-12-14 19:39:49
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本帖內(nèi)容被屏蔽 |
4樓2015-12-15 16:18:33
jiangph
鐵蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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大致就是你寫(xiě)的這樣，但是要加vasp運(yùn)行的命令 手機(jī)回復(fù)，不方便添加我自己的腳本，如果有需要的話回頭給你貼一個(gè) 發(fā)自小木蟲(chóng)IOS客戶端 |
5樓2015-12-15 21:22:25
6樓2015-12-15 23:59:00
jiangph
鐵蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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PBS腳本不是shell腳本么？ 這是我們用來(lái)測(cè)試K點(diǎn)的腳本，題主可以參考一下 #!/bin/bash #PBS -N kpoints #PBS -j oe #PBS -l nodes=2:ppn=20 #PBS -l walltime=800:00:00 #PBS -q lhj nprocs=`wc -l < $PBS_NODEFILE` cd $PBS_O_WORKDIR for i in 3 5 7 9 11 13 15 do cat >KPOINTS <<! auto generate 0 M $i $i 1 0 0 0 ! /public/intel/impi/4.1.0.024/intel64/bin/mpirun -np $nprocs ~/bin/vasp.5.3 E=`grep "entropy =" OUTCAR |tail -1| awk '{printf "%12.6f \n",$5}'` echo $i $E >>newkpoints rm WAVECAR CHG* done |
7樓2015-12-16 09:58:00
8樓2015-12-16 22:03:42
qiqiangong
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9樓2019-10-02 15:17:05
qiqiangong
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10樓2019-10-02 15:34:18
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