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ShawnXu1986新蟲 (初入文壇)
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[交流]
水分子模擬，如何解決由于正負(fù)電荷點過于靠近導(dǎo)致的平均動能過大問題？
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各位前輩，大家好。 小弟自己寫了個水分子模擬程序，NVE ensemble，使用了TIP3P, TIP5P水分子模型。在計算庫侖力時使用的是Ewald summation。 在這兩個模型中，正電荷位于Ｈ原子上，負(fù)電荷位于Ｏ原子上或者Ｍ site上。當(dāng)O 原子和Ｈ原子特別靠近時，由于正負(fù)電荷吸引，庫侖力會使得這兩個原子靠近，但越靠近庫侖力越大，則兩個原子更加靠近！！ 由于LJ勢能只應(yīng)用在O-O 原子之間，所以沒有排斥力使得這一對ＯＨ原子分開，這兩種原子只能由極高的速度逃脫彼此，避免碰撞在一起。 但這就導(dǎo)致了整個系統(tǒng)的平均動能變得非常大，使得模擬的溫度不合常理的高（大于10000Ｋ）�！� 我想到的一個辦法是在每一步都對速度進行等比縮小，使得系統(tǒng)平均動能給出的溫度能夠靠近我想要的溫度（比如300K）。但這個辦法并不可行。因為兩個電荷點避免碰撞在一起需要兩個電荷點有較高的速度，如果沒有速度，那么這兩個電荷就最終重疊到一起了，使得計算崩潰。 請各位能夠幫幫我，支出我的理解是否有誤，并請給我指出正確的方向，非常感謝  |
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