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ShawnXu1986新蟲(chóng) (初入文壇)
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[交流]
水分子模擬，如何解決由于正負(fù)電荷點(diǎn)過(guò)于靠近導(dǎo)致的平均動(dòng)能過(guò)大問(wèn)題？
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各位前輩，大家好。 小弟自己寫(xiě)了個(gè)水分子模擬程序，NVE ensemble，使用了TIP3P, TIP5P水分子模型。在計(jì)算庫(kù)侖力時(shí)使用的是Ewald summation。 在這兩個(gè)模型中，正電荷位于Ｈ原子上，負(fù)電荷位于Ｏ原子上或者Ｍ site上。當(dāng)O 原子和Ｈ原子特別靠近時(shí)，由于正負(fù)電荷吸引，庫(kù)侖力會(huì)使得這兩個(gè)原子靠近，但越靠近庫(kù)侖力越大，則兩個(gè)原子更加靠近��！ 由于LJ勢(shì)能只應(yīng)用在O-O 原子之間，所以沒(méi)有排斥力使得這一對(duì)ＯＨ原子分開(kāi)，這兩種原子只能由極高的速度逃脫彼此，避免碰撞在一起。 但這就導(dǎo)致了整個(gè)系統(tǒng)的平均動(dòng)能變得非常大，使得模擬的溫度不合常理的高（大于10000Ｋ）�！� 我想到的一個(gè)辦法是在每一步都對(duì)速度進(jìn)行等比縮小，使得系統(tǒng)平均動(dòng)能給出的溫度能夠靠近我想要的溫度（比如300K）。但這個(gè)辦法并不可行。因?yàn)閮蓚�(gè)電荷點(diǎn)避免碰撞在一起需要兩個(gè)電荷點(diǎn)有較高的速度，如果沒(méi)有速度，那么這兩個(gè)電荷就最終重疊到一起了，使得計(jì)算崩潰。 請(qǐng)各位能夠幫幫我，支出我的理解是否有誤，并請(qǐng)給我指出正確的方向，非常感謝  |
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7樓2015-12-18 12:24:21
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6樓2015-12-17 15:48:26
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