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Tricine—SDS—PAGE電泳分析小分子多肽 已有2人參與
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物質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量范圍在 10~200 kDa,對(duì)于相對(duì)分子質(zhì)量小于 10kDa的多肽分辨率低uJ。Swank等在含有 SDS的凝膠中加人 8mol·LI1的脲,但分離效果不甚理想,且重 現(xiàn)性較差。Lanzilo等發(fā)現(xiàn)在Laemmli系統(tǒng)和僅在樣品和電極緩沖液中有 SDS的不連續(xù)緩沖系統(tǒng)中,低分子量多肽常常堆積在濃縮膠中【2l,之后 Scba~ r等【3]又進(jìn)行 了系統(tǒng)地研究和探索,能夠分離較大相對(duì)分子質(zhì)量范圍內(nèi)的蛋白質(zhì).隨著生物技術(shù)的飛速發(fā)展和基因工程藥物的大量涌現(xiàn),具有高生物活性的小分子多肽的分離、純化和鑒定技術(shù)極為重要。本文報(bào)道采用 Tris.Tricine緩沖體系,對(duì) SDS-PAGE方法的各個(gè) 環(huán)節(jié)進(jìn)行了改進(jìn),在較低的丙烯酰胺濃度下取得了較理想的結(jié)果。 1 材料和方法 1.1 試劑和儀器 SDS為華美生物工程公司產(chǎn)品;丙烯酰胺 (分析 純)為上海綠鳥(niǎo)科技發(fā)展有限公司產(chǎn)品;N—N’甲叉 雙丙烯酰胺 (分 析純 )為 Fluka公 司產(chǎn)品;Tris為 PI'咖e 公司產(chǎn)品;Tricine、TEMED、過(guò)硫酸銨均為上 海生工 AMRKSCO分裝產(chǎn) 品;脲 (分 析純)為無(wú)錫市 民豐試劑廠產(chǎn)品 ;肽分子量標(biāo)準(zhǔn) 的分子量范圍1060 ~ 266OO為美國(guó) Sigma公司產(chǎn)品。EPS604穩(wěn)壓穩(wěn)流 電泳儀(南京科寶儀器研究所);小型垂直電泳附件1.2.2 膠的制備 在垂直電泳附件模具中,按表 3給 出的數(shù)據(jù)依次灌注分離膠、間隙膠和濃縮膠,采用 4種不同的分 離膠配比方法,進(jìn)行 比較實(shí)驗(yàn)。 1.2.3 電泳 分別按表 1的組 成加陽(yáng)極及陰極緩沖液,先 60V電泳 1h,當(dāng)樣品進(jìn)人分離膠時(shí),將實(shí)驗(yàn)的電壓 分別升到 100V,85V,95V,95 V進(jìn)行 比較,直至樣 品中染料遷移至離下端 1cm時(shí)停止. 多肽 取出平板中的凝膠立即浸泡于固定液 (50%乙醇,10%冰 乙酸 )中固定 1h,再將 固定后的凝膠置于45℃的染色液 (1g·L 考馬斯亮藍(lán) R-250的 25%乙醇,8%冰乙酸 )中浸泡 l5~30min,然后用蒸餾水將凝膠淋洗一次,最后,多次變換脫色液(25%乙醇,8%冰乙酸,以上均為體積分?jǐn)?shù)),直至凝膠上背景脫凈為 I七。 2 結(jié)果和討論 4種不同類(lèi)型膠的蛋白標(biāo)準(zhǔn)分離結(jié)果如圖 1。對(duì)后兩種類(lèi)型膠的分離結(jié)果以其 w對(duì)數(shù) (1gMw)和在分離膠中的相對(duì)遷移率( ,)進(jìn)行了直線回歸分析(圖 2),相關(guān) 系數(shù) r分別為 0.896和 0.892。 多肽合成 由圖 1可 以看出,分離膠 0.1T,3%C的 SDS-PAGE電泳可以分析分辨 5kDa以上的蛋白,該類(lèi)型的膠相對(duì)于其它類(lèi)型膠來(lái)說(shuō)產(chǎn)生的熱量較小,但是低于5000Da的多肽很難分辨。分離膠.0.165T,3%C圖 1 4種不同類(lèi)型膠分離標(biāo)準(zhǔn)蛋白的 SDS-PAGE可 比較清楚地分離 3kDa以上的多肽,而 1kDa相近的蛋白帶無(wú)法觀察,若低于5000Da的多肽分離不很重要的話,完全可以省去間隙膠的使用;分離膠 0.165T,6%C(不 含脲 )的 SDS-PAGE電泳對(duì)于 1~20kDa的多肽有很好的分辨率。在第 4種類(lèi)型的分離膠中添加脲,如 Swank和 Munkres所述,低于5000Da的蛋白條帶清晰度增加。脲使用 與否的主要區(qū)別在于蛋白的具體性質(zhì),有些蛋白沒(méi)有脲時(shí)分離效果更好,但是有些蛋白的分離就需要 子多肽的擴(kuò)散、丟失。在含 SDS緩沖液 的樣品中, 添加脲時(shí)才能更好分辨。但在一般小分子肽的分離 小分子多肽的濃縮是較困難的 ,因?yàn)樾》肿佣嚯呐c 中,有無(wú)脲的添加對(duì)電泳結(jié)果無(wú)明顯影響。根據(jù)相 SDS形成的復(fù)合體具有與 SDS本身類(lèi)似的電荷和大 對(duì)遷移率與標(biāo)準(zhǔn)蛋白相對(duì)分子質(zhì)量對(duì)數(shù)的曲線 (圖 小,因此濃縮對(duì)于小分子多肽的 SDS-PAGE來(lái)說(shuō)就 2)可見(jiàn),5種蛋白的計(jì)算相對(duì)分子質(zhì)量精確度為 成了一個(gè)突出的問(wèn)題【4J。 多肽合成圖片 多肽合成圖片1 我們采用的方法中利用 ±10%,屬于電泳法測(cè)定相對(duì)分子質(zhì)量的正常誤差 Tficme緩沖體系,分離膠和濃縮膠中采用相同的 pH 范圍。僅有最低相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)蛋白( l06o) 值,并在較低的丙烯酰胺濃度的電泳條件下,使小分的計(jì)算值與實(shí)際相對(duì)分子質(zhì)量有一定差異,這主要是因?yàn)樾‰牡南鄬?duì)分子質(zhì)量越小,其固有電荷及其構(gòu)象對(duì)泳動(dòng)率的影響就越大。以上結(jié)果表明該法在實(shí)際工作中可為研究者提供較為可靠的分離條件及分析結(jié)果。SDS-PAGE電泳的有效分離范圍取決于聚丙烯酰胺的濃度和交聯(lián)度,相對(duì)分子質(zhì)量低 于10000的小分子肽即使用較高濃度的聚丙烯酰胺也不能完全分離。我們通過(guò)比較發(fā)現(xiàn),采用分離膠 0.165T,6%C(含或不含脲 )的梯度膠電泳 ,即可把標(biāo)準(zhǔn)品的6條帶顯示得非常清楚,上樣量小,重復(fù)性好。固定、染色和脫色過(guò)程中未使用甲醇,且在電泳后通過(guò)加熱速染色避免了凝膠的膨脹變形,而且 甲醇會(huì)使sDS_蛋白復(fù)合體中的 SDS游離出來(lái)而導(dǎo)致一些小分子多肽能夠有效地壓縮和去壓縮。而且電泳體系中不使用甘氨酸和脲,可以為后來(lái)的氨基酸序列測(cè)定免除干擾。 原文地址:ontores-新浪博客 |
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