 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3233 | 回復(fù): 9 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
[交流]
任務(wù)越大，高斯并行效率越好（任務(wù)實(shí)測結(jié)果） 已有6人參與
|
|||
|
測試了兩個任務(wù)，一個小任務(wù)和一個較大的任務(wù)。結(jié)果顯示小任務(wù)的并行效率很差，而大任務(wù)的并行效率非常好。當(dāng)任務(wù)較小時，本來計算量就很小，還要分配給很多核去計算，核之間的數(shù)據(jù)交換和進(jìn)行協(xié)調(diào)的時間變長，可能出現(xiàn)“核浮于事”的情況，造成并行效率很差。但如果計算量很大，核心根本不夠用，每個核都拼命地工作還是算不完的話，核的并行效果就非常好了。 說一下測試的機(jī)器，是學(xué)校的超算中心，每個節(jié)點(diǎn)2個CPU，共20核心，具體CPU型號不知道，聽說是E5的工作站專用核心吧，64G內(nèi)存。軟件為Gaussian09 D0.1版，linux系統(tǒng)。 因此，如果任務(wù)小的話，就2核，4 核，8核并行，如果任務(wù)大的話，就8核，12核，16核，20核一起并行計算，效果會很好。當(dāng)然這個只是在學(xué)校的超算電腦上的測試結(jié)果，對于其他型號的機(jī)器不知道能否通用，僅作為一個參考吧。 測試實(shí)例如下所示： 一個較小的任務(wù)，34個原子（含C,H元素）的分子B3LYP/6-31+G(D,P)水平下優(yōu)化，basis function 478, 12步優(yōu)化結(jié)束，%mem=1000MW，CPU time: 200分鐘，用不同核心來并行，結(jié)果如下： 1核CPU time:204分鐘，實(shí)際用時204分鐘 2核CPU time:213分鐘，實(shí)際用時107分鐘 4核CPU time:229分鐘，實(shí)際用時57分鐘 6核CPU time:236分鐘，實(shí)際用時40分鐘 8核CPU time:241分鐘，實(shí)際用時27分鐘 12核CPU time:269分鐘，實(shí)際用時23分鐘 16核CPU time:433分鐘，實(shí)際用時30分鐘 20核CPU time:541分鐘，實(shí)際用時47分鐘 一個較大的Gaussian的任務(wù)，140個原子（含C,H,O,N元素）的分子B3LYP/6-31+G(D,P)水平下優(yōu)化，basis function 1848，16步優(yōu)化結(jié)束，CPU time14天以上（336小時以上）。%mem=1000MW，分別用不同的核去計算： 4核心，CPU time：351小時，實(shí)際用時88小時（88*4=352小時） 8核心，CPU time：342小時，實(shí)際用時43小時（43*8=344小時） 12核心，CPU time：336小時，實(shí)際用時28.5小時（28.5*12=342小時） 16核心，CPU time：342小時，實(shí)際用時21.5小時（21.5*16=344小時） 20核心，CPU time：350小時，實(shí)際用時18.7小時（18.7*20=374小時） |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
求助電催化劑制備，怎么在碳布表面生長PdCo合金
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
求助電催化劑制備，怎么在碳布表面生長PdCo合金
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有95人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
上海華東理工大學(xué)機(jī)械與動力工程學(xué)院先進(jìn)材料與制造研究組招聘公告
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
304求調(diào)劑
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
一志愿985中藥學(xué)306，求調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
河南一本高�；瘜W(xué)，材料，化工專業(yè)招收研究生
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
大連海事大學(xué)船舶潔凈能源研究中心2026年博士研究生招生啟事
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
|
不好意思，我最多用一個node的20個核并行一個任務(wù)。沒用過比如2個node的40核算一個任務(wù)的情況。據(jù)說node和node之間數(shù)據(jù)交換要慢一些。估計用2個node分別算2個任務(wù)，要比用2個node共同算一個任務(wù)再算一個任務(wù)要快。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
9樓2015-12-23 14:24:57
4樓2015-12-23 10:53:55
biloba
木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 2117.4
- 紅花: 1
- 帖子: 555
- 在線: 89.6小時
- 蟲號: 124611
- 注冊: 2005-12-06
- 專業(yè): 分子與進(jìn)化生態(tài)學(xué)
5樓2015-12-23 11:52:23
6樓2015-12-23 12:10:54
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷 +6 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-17 | 10/500 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 一志愿 西北大學(xué) ，070300化學(xué)學(xué)碩，總分287，雙非一本，求調(diào)劑。 +3 | 晨昏線與星海 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +4 | 來好運(yùn)來來來 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 呼呼？~+123456 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 工科0856求調(diào)劑 +3 | 沐析汀汀 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
[考研] 求助 +5 | 夢里的無言 2026-03-21 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 313求調(diào)劑 +4 | 肆叁貳壹22 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +4 | 某某某某位 2026-03-21 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +6 | Mqqqqqq 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 265求調(diào)劑 +3 | Jack?k?y 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 南京大學(xué)化學(xué)376求調(diào)劑 +3 | hisfailed 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +7 | 司空. 2026-03-18 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿:南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分 +4 | @taotao 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研]
 材料與化工 322求調(diào)劑
+4
|
然11 2026-03-19 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿吉林大學(xué)材料學(xué)碩321求調(diào)劑 +11 | Ymlll 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 08工學(xué)調(diào)劑 +5 | 用戶573181 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 招收調(diào)劑碩士 +4 | lidianxing 2026-03-19 | 12/600 |
|
|
|
[考博] 申博26年 +3 | 八6八68 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 328求調(diào)劑，英語六級551，有科研經(jīng)歷 +4 | 生物工程調(diào)劑 2026-03-16 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 淇ya_~ 2026-03-17 | 5/250 |
|