 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 3968 | 回復(fù): 8 | |||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點(diǎn)擊這里查看本話題的所有回帖 | |||
獨(dú)自的奮斗金蟲 (正式寫手)
|
[交流]
提高國自然中標(biāo)率之選題 已有8人參與
|
||
|
好長時(shí)間沒有寫分享文章了，看了下nature，從7579,7580，最近一期是7581，季博都沒看，這樣算來已經(jīng)快一個(gè)月沒有寫了。抱歉抱歉，不是季博偷懶，而是這段時(shí)間實(shí)在太忙，不是出差講座就是幫人看課題。不過，今天寫分享文章，不是空閑了，而是覺得這個(gè)事情很重要，需要跟大家說說，避免大家走彎路。 季博從09年開始就幫人看課題，這么多年，發(fā)現(xiàn)國自然每年的水平都在提高。14和15年的一審意見，很多專家指出的問題，都很專業(yè)。雖然很多是大同行在評審，但對于課題研究思路，研究方法，指出的問題是一針見血。很開心。按照這樣的發(fā)展速度，中國的科研水平超過老美指日可待。 不少分析整體構(gòu)成的理論中會(huì)用到金字塔型，也就是優(yōu)秀的是塔尖是少數(shù)，大部分是在下面，形成基座。但其實(shí)，科研中并不是這樣，而是豎起來的紡錘形，優(yōu)秀的個(gè)尖，不優(yōu)秀的也是個(gè)尖，良好的是大部分，是那個(gè)胖胖的腰。我們在跟人學(xué)習(xí)時(shí)，多跟上面的尖學(xué)習(xí)。今天季博就聊聊上面那個(gè)尖的東西。 現(xiàn)在國自然分為臨床口和基礎(chǔ)口，這個(gè)是有道理的，因?yàn)閷τ谏暾埲思罢n題要求是不同的。 季博講座中一開始就聊疾病研究的歷史，其實(shí)這個(gè)研究歷史放到基礎(chǔ)科研中也一樣。 1、疾病臨床表現(xiàn)。 2、尋找臨床表現(xiàn)發(fā)生的器官組織。 3、探索器官組織中最小功能單位細(xì)胞，什么細(xì)胞與正常細(xì)胞不同從而造成器官組織有問題，導(dǎo)致臨床表現(xiàn)的。 4、繼續(xù)，尋找為什么這個(gè)細(xì)胞與正常細(xì)胞不同，誰造成的。找基因。 5、這個(gè)基因?yàn)樯犊梢詫?dǎo)致這個(gè)細(xì)胞與正常細(xì)胞不同，從而造成器官組織有問題，導(dǎo)致臨床表現(xiàn)的。找機(jī)制。 圖1 以上是疾病研究的歷史。而作為一個(gè)研究課題，其實(shí)就是以下三方面工作了。 1、基因與疾病的關(guān)系。解決的是前面1和2。 2、基因與功能的關(guān)系。解決的是前面3和4。這里的功能證明，最好是in-vitro 和in-vivo。 3、基因與機(jī)制的關(guān)系。解決的是前面的5。目前科研課題的深度也在這里。 圖2 都是圍繞基因在做工作，這里的“基因”不同人有不同人的看法。生命活動(dòng)的三大物質(zhì)，核酸，蛋白，脂。脂，歸為能量方面。核酸，主要為遺傳方面，這幾年才開始關(guān)注其調(diào)控方面。調(diào)控誰呢，主角來了，蛋白。蛋白，為生命活動(dòng)主要干活的。所以，任何深入的科研工作，都不會(huì)離開蛋白。不管是研究脂，還是核酸（比如microRNA，lncRNA）。 課題創(chuàng)新性體現(xiàn)在 什么地方呢。大家注意了。這三個(gè)環(huán)節(jié)都可以，看您自己的科研能力。 放基因與疾病的關(guān)系，這個(gè)是最容易的，也是現(xiàn)在大家都在做的。 放基因與功能的關(guān)系。人類基因組計(jì)劃已經(jīng)完成，多少蛋白編碼基因其實(shí)很清楚。一個(gè)基因功能沒有被報(bào)道過，要找到其功能，其實(shí)不是拿著基因去找功能。而是先確定功能表型，然后找相關(guān)的基因。這個(gè)工作很多是在模式生物上進(jìn)行，然后再到人上來。到人上來時(shí)，如果有功能，但跟疾病沒啥關(guān)系，那么就是基礎(chǔ)研究工作。如果跟疾病有關(guān)系，那么也可以往臨床基礎(chǔ)研究去發(fā)展。很多遺傳病的研究其實(shí)就是這個(gè)路徑，用家系測突變，發(fā)現(xiàn)一堆突變，然后分析，發(fā)現(xiàn)某個(gè)突變在某個(gè)基因上，而這個(gè)基因在模式生物研究中跟啥啥功能相關(guān)。OK，就看這個(gè)突變，這個(gè)基因，這個(gè)功能，是否促進(jìn)了這個(gè)疾病的發(fā)生發(fā)展。這時(shí)，你可以認(rèn)為創(chuàng)新性在基因與疾病的關(guān)系，也可以是加上基因與功能的創(chuàng)新性（在人的研究中）。不過，如果這個(gè)基因在人中已經(jīng)研究過功能，只不過沒有報(bào)道過跟這個(gè)疾病的關(guān)系，那么創(chuàng)新性就只在基因與疾病的關(guān)系了。 放基因與機(jī)制的關(guān)系。這個(gè)地方比較復(fù)雜。如果前面兩個(gè)都沒有創(chuàng)新性，而要在機(jī)制有創(chuàng)新性的話，需要是直接互作關(guān)系。且這類研究是基礎(chǔ)口的課題。 臨床口與基礎(chǔ)口的區(qū)別。 臨床口，創(chuàng)新性在基因與疾病的關(guān)系。后面的基因與功能，基因與機(jī)制，其實(shí)是配角，錦上添花。不過，不能少。且現(xiàn)在要求越來越高，在設(shè)計(jì)和實(shí)驗(yàn)中，盡量探索深些。 基礎(chǔ)口，創(chuàng)新性在基因與功能，或基因與機(jī)制。基因與功能，需要一定的運(yùn)氣，基因與機(jī)制，雖然也需要運(yùn)氣，但主要的是靠技術(shù)實(shí)力。所以，大牛們即使拿到一個(gè)與功能有創(chuàng)新性的基因，仍然不會(huì)停止腳步，繼續(xù)挖掘基因與機(jī)制的關(guān)系。而其實(shí)，目前基因與機(jī)制的關(guān)系，是發(fā)高分文章頂級雜志占比最大的。 大家注意了，扯了這么多臨床口與基礎(chǔ)口，其實(shí)把科研分為臨床口與基礎(chǔ)口，是國家基金委為了保護(hù)做臨床科研的人。雖然從雜志的分類來說，也會(huì)有偏臨床研究的雜志，但一個(gè)課題的高度是看其研究探索的深度，是體現(xiàn)在機(jī)制上的。所以，做臨床研究的人，千萬別輕視機(jī)制的深度。只不過是要把創(chuàng)新放在基因與疾病的關(guān)系上。 羅嗦了這么多，開始主題了。 在12年以前，找季博指導(dǎo)國自然課題，季博會(huì)說，很簡單，找個(gè)有創(chuàng)新性的功能基因就可以了。現(xiàn)在找季博指導(dǎo)課題，第一句話問，以前做過什么研究工作。 大家的科研水平都提高了，現(xiàn)在的大環(huán)境，申請國家自然基金，需要評估申請人的背景。也就是以往的研究工作。近兩年就有不少人，一審返回意見，直接就說申請人沒有相關(guān)的研究基礎(chǔ)。那么這個(gè)地方，我們要怎么做呢。 1、以往沒有發(fā)表過文章。這種情況下，一般為年輕人，申請青年基金，那么就看碩士或博士課題是做啥，參與的文章是什么。 2、以往發(fā)表過文章。但，做的工作中沒有涉及到基因。OK，看是做的什么工作。根據(jù)這個(gè)工作，去尋找一個(gè)有創(chuàng)新性的功能基因，設(shè)計(jì)課題去申請。對于臨床的人，一般是研究疾病，那么就根據(jù)這個(gè)疾病，去尋找跟疾病相關(guān)的有創(chuàng)新性的功能基因。注意，疾病不要換。換疾病就是換方向。如果，非要換疾病，這個(gè)對于申請課題來說，是減分的行為。如果要提高中標(biāo)率，那么看您是否有5分以上文章，說明自己研究能力是OK的，只不過有些原因造成需要更換方向。（比如研究生是研究一個(gè)疾病，參加工作后做另一個(gè)疾病，這種情況是可以的。） 3、以往發(fā)表過文章，涉及到基因。這個(gè)時(shí)候，有兩種方案。 一種是，拿這個(gè)基因換個(gè)疾病，只要在第二個(gè)疾病中沒有報(bào)道過，確保基因與疾病的創(chuàng)新性。大家注意，這樣去做，發(fā)文章是沒有問題的。不過，對于申請基金來說，看你是什么身份，如果你是在科學(xué)院所，或者醫(yī)院里的專職科研人員。這個(gè)是可以的。以前很多大牛，就是發(fā)現(xiàn)一個(gè)基因的功能，然后在不同的疾病中去探索與疾病發(fā)生發(fā)展的關(guān)系。不過，對于臨床醫(yī)生來說，就不合適了。因?yàn)榕R床醫(yī)生的科研方向其實(shí)是疾病。對于臨床醫(yī)生，疾病千萬不要輕易改變。這個(gè)是大忌。那咋辦吶。 另一種方案。疾病不變，換基因。換什么基因呢，比如前面發(fā)文章的是A1，那么根據(jù)這個(gè)A1尋找與A1相關(guān)，有創(chuàng)新性的疾病相關(guān)功能基因A2。這個(gè)方案，其實(shí)是現(xiàn)在的大牛們在做的事情，尋找A1相關(guān)直接互作的新A2。把A2作為A1發(fā)揮功能的新機(jī)制。這部分，大家可以看看“課題設(shè)計(jì)思路升級篇-高分思路”�？梢酝鵄1上游找，比如A1啟動(dòng)子上的轉(zhuǎn)錄因子，microRNA，lncRNA等等。也可以往下游找，找A1直接互作的分子。不過，這個(gè)直接互作是10分以上文章的要求，很難吶。那咋辦。其實(shí)我們技術(shù)能力沒辦法找到直接互作的，我們可以找不直接互作的呀。講座中，機(jī)制中的I類機(jī)制，季博說，只要你去做肯定會(huì)有結(jié)果。A1在細(xì)胞中干擾或過表達(dá)，你已經(jīng)做過，是有功能的，那么還在這個(gè)細(xì)胞中做干擾或過表達(dá)，去做全基因組表達(dá)譜芯片，看有哪些差異基因。對于A1的機(jī)制，把差異基因pathway聚類后，找信號通路的節(jié)點(diǎn)分子進(jìn)行QPCR和WB驗(yàn)證，陽性的放文章里面作為I類機(jī)制。因?yàn)檫@個(gè)芯片做完，差異基因是成百上千的，所以，只要你去做肯定會(huì)有（會(huì)不會(huì)有人說，這么多，怎么做。OK，找業(yè)務(wù)員吧。公司有個(gè)patharray服務(wù)，就是這么做的，WB驗(yàn)證3個(gè)陽性才算服務(wù)完成）。A1的事情結(jié)束了，看看這芯片數(shù)據(jù)，你會(huì)看到很多沒見過的基因。OK，把未在您研究疾病中發(fā)表過文章的基因分析出來，做高通量功能篩選。再臨床樣品驗(yàn)證。這樣你就拿到一個(gè)有創(chuàng)新性的疾病功能基因A2。這個(gè)A2是A1的下游，屬于延續(xù)性課題。高通量功能篩選，大家記住這個(gè)詞。想加深印象，看季博qq空間“mRNA剪切調(diào)控splicing-藥靶-高通量功能篩選”這篇nature文章的分析。這個(gè)作者11年做的高通量功能篩選，12年把篩選出來的基因中，跟SUMO化相關(guān)的一個(gè)基因發(fā)了nature，因?yàn)槟莻�(gè)時(shí)候，蛋白修飾比較熱。今年，splicing熱起來了，就把篩選出來的基因中跟splicing相關(guān)的一個(gè)基因今年又發(fā)一篇nature。 今天扯了有點(diǎn)多，不知道大家是否被搞暈了。其實(shí)就一點(diǎn)，選題需要結(jié)合您的科研背景。對于臨床醫(yī)生，不要輕易更換疾病。沒做過基因的，根據(jù)疾病找基因。做過基因的，根據(jù)基因繼續(xù)深入。這是科研領(lǐng)域的發(fā)展方向。 轉(zhuǎn)自：https://www.dxslt.cn/forum.php?m ... amp;amp;from=portal |
回復(fù)此樓» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
wddong1988» 猜你喜歡
317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
340求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求調(diào)劑，一志愿 南京航空航天大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩，總分289分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿武漢理工，總分321，英一數(shù)二，求老師收留。
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
一志愿北化求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
085601材料工程找調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
318一志愿吉林大學(xué)生物與醫(yī)藥 求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿雙一流機(jī)械285分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
332求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
yawei1983
鐵蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 156.8
- 散金: 10
- 帖子: 46
- 在線: 19.6小時(shí)
- 蟲號: 726651
- 注冊: 2009-03-19
- 專業(yè): 生物海洋學(xué)與海洋生物資源
9樓2020-10-30 10:49:40
3樓2016-01-24 08:01:04
匿名
榮譽(yù)版主 (知名作家)
- 應(yīng)助: 124 (高中生)
- 貴賓: 0.776
- 金幣: 9451.4
- 散金: 2821
- 紅花: 31
- 沙發(fā): 6
- 帖子: 8237
- 在線: 139.4小時(shí)
- 蟲號: 0
- 注冊: 2008-06-05
- 性別: GG
- 專業(yè): 病毒學(xué)
- 管轄: 基金申請
 本帖僅樓主可見 |
6樓2016-02-17 11:23:09
專屬cc
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 5 (幼兒園)
- 金幣: 1732.6
- 散金: 200
- 紅花: 4
- 帖子: 135
- 在線: 71.7小時(shí)
- 蟲號: 2791595
- 注冊: 2013-11-10
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物生理與生物化學(xué)
7樓2016-08-26 11:37:29
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +8 | 鈕恩雪 2026-03-25 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿北京化工大學(xué)材料與化工（085600）296求調(diào)劑 +13 | 稻妻小編 2026-03-26 | 13/650 |
|
|
|
[考研] 309求調(diào)劑 +6 | 誰不是少年 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +4 | akie... 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 本科新能源科學(xué)與工程，一志愿華理能動(dòng)285求調(diào)劑 +3 | AZMK 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿中南大學(xué)化學(xué)0703總分337求調(diào)劑 +5 | niko- 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +6 | 蘆lty 2026-03-25 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料與化工（0856）304求B區(qū)調(diào)劑 +8 | 邱gl 2026-03-27 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 295求調(diào)劑 +5 | 1428151015 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 352分 化工與材料 +5 | 海納百川Ly 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085601 材料工程 313分 求調(diào)劑 +5 | Ong3 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315調(diào)劑 +4 | 0860求調(diào)劑 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +6 | 林之夕 2026-03-24 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 材料調(diào)劑 +8 | 匹克i 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求調(diào)劑 +4 | 李李不服輸 2026-03-25 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 284求調(diào)劑 +15 | Zhao anqi 2026-03-22 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 一志愿武理085500機(jī)械專業(yè)總分300求調(diào)劑 +3 | an10101 2026-03-24 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 材料/農(nóng)業(yè)專業(yè)，07/08開頭均可，過線就行 +3 | 呵唔哦豁 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境，總分308求調(diào)劑 +7 | 墨墨漠 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | ALULU4408 2026-03-23 | 3/150 |
|