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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp腳本問題
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小雨熊木蟲 (正式寫手)
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[求助]
vasp腳本問題 已有1人參與
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pbs提交任務的腳本 在單獨運行vasp任務時可以用，但是在pbs腳本中調用force腳本，任務就不動了，是哪里搞錯了？ 未命名.JPG |
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9樓2016-01-24 21:41:09
2樓2016-01-23 17:29:23
小雨熊
木蟲 (正式寫手)
- 應助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1513.5
- 散金: 120
- 紅花: 2
- 帖子: 546
- 在線: 318.9小時
- 蟲號: 1431950
- 注冊: 2011-10-08
- 專業(yè): 半導體材料
3樓2016-01-23 17:55:10
小雨熊
木蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 半導體材料
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#!/bin/sh for a in 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 do cp POSCAR-0$a POSCAR mpiexec -np 20 vasp >> log cp vasprun.xml vasprun.xml-0$a done 這個是force文件 正常執(zhí)行的結果應該是在log文件中顯示 running on 2 nodes distr: one band on 2 nodes, 1 groups vasp.5.2.2 15Apr09 complex POSCAR found : 2 types and 16 ions LDA part: xc-table for Pade appr. of Perdew POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup FFT: planning ...( 1 ) reading WAVECAR entering main loop N E dE d eps ncg rms rms(c) RMM: 1 0.709851747703E+03 0.70985E+03 -0.27547E+04 1640 0.141E+03 但是現(xiàn)在log文件顯示 POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup WARNING: small aliasing (wrap around) errors must be expected FFT: planning ... WAVECAR not read 然后卡住不動 |
4樓2016-01-23 18:26:19
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