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dreamfly_ykf木蟲 (正式寫手)
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[求助]
nvt模擬要求表示壓力,如何回答?
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如題,使用nvt模擬了一個晶體,審稿人問題如下: If the NVT runs were production run, please show the pressure variation during simulation run as supporting information 做模擬的都知道壓力波動很大,盡管輸出文件中有壓力值,基本上都是在幾百Mpa波動,和實驗值是相差很大的 要做圖獲得模擬期間壓力的變化,這樣結(jié)果很不好看,說不定審稿人又提出,壓力和實際不符和等問題 請問有人發(fā)文章時候,被問及壓力波動嗎,如何回答啊。 |
分子動力學模擬 |

專家顧問 (正式寫手)
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專家經(jīng)驗: +49 |
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瞬時壓力波動大是NVE/NVT模擬中很常見的現(xiàn)象,為了減小波動最有效的方法是增加體系尺寸,因為統(tǒng)計力學中漲落是和粒子數(shù)的平方根成反比的。 http://www.gromacs.org/Documentation/Terminology/Pressure 這個問題之前在lammps mailing list里也有人問過,唯一的解決方法就是增加體系尺寸,你可以看看這個帖子及相關回帖 http://lammps.sandia.gov/threads/msg33152.html 如果你的體系比較小,那么瞬時壓力波動大是再正常不過了。 你可以計算一下你的壓力均值,看看跟設定值有多大差距;蛘,可以像下面這張圖,每隔一定步數(shù)(比如每100步)對壓力取平均作圖,如果這樣計算出來的壓力和你設定值差距不大就沒問題。 http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... zyme/07_equil2.html |
木蟲 (正式寫手)
專家顧問 (正式寫手)
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專家經(jīng)驗: +129 |

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