跪求，可以計(jì)算熱力學(xué)的如見及教程，如焓變、吉布斯自由能等，各位大神江湖救急啊

做纖維素模擬時(shí)，在網(wǎng)上下載了一個(gè)cif文件，想從里邊提取出纖維素的分子坐標(biāo)，由分?jǐn)?shù)坐標(biāo)轉(zhuǎn)換成卡迪爾坐標(biāo)，怎么轉(zhuǎn)換？可以由cif文件直接轉(zhuǎn)換嗎？看了好多方法好像是需要自己寫公式，然后編程去實(shí)現(xiàn)，請(qǐng)教各位有沒有好的方法可以傳授一下！跪謝！

大半夜越想越?jīng)]出路。這可咋整呢

為什么我跑完動(dòng)力學(xué)算出來的相互作用能量達(dá)到了幾萬KJ/mol，最低的時(shí)候也有七八千……求各位大神指導(dǎo)下，能量在多少范圍內(nèi)是合理的？（計(jì)算公式：E總-Ea-Eb）

分享《分子的模擬與實(shí)踐》

有對(duì)利用分子模擬研究無機(jī)鹵素鈣鈦礦材料CsPbBr3或者CsPbI3感興趣的同學(xué)，可以使用以下這個(gè)簡(jiǎn)單的模型試一試（lammps的格式）：CsPbBr3:groupCstype1groupPbtype2groupBrtype3mass1132.9mass220...

建立晶胞的時(shí)候那個(gè)Entergroup是怎么選擇的呢

請(qǐng)問大家lammps能模擬金屬與非金屬之間的界面問題嗎

我想用Lammps求氣液，液液的界面張力，公式是這個(gè)公式：tension=1/2(Pzz-(Pxx+Pyy)/2)Lz.嘗試過多次，始終得不出正確結(jié)果。求幫助。謝謝

南科大生物系MDsimulation博士后職位空缺，有興趣的下面回復(fù)即可。

lammps計(jì)算出的voronoi數(shù)據(jù)中原子體積很大，有2910.6的數(shù)值正確嗎

誰有mac版pymol軟件，萬分感謝

不定形聚合物，密度可以有很大范圍的變化，系統(tǒng)優(yōu)化后怎么才能查看密度變化呢？

最近在安裝這個(gè)開源軟件，怎么都不成功，有沒有熟練的老哥，幫幫忙，另一做什么大家也可以互相交流，取長(zhǎng)補(bǔ)短。

《計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)》指明，“用于構(gòu)建方程的訓(xùn)練集最好不要超過50個(gè)化合物”。個(gè)人認(rèn)為，訓(xùn)練集化合物數(shù)量越多越好，像是過擬合等問題，應(yīng)該從算法找原因，不是訓(xùn)練集過多的問題。為什么qsar的訓(xùn)練集不能過多？謝謝同好們！

本人MS新手最近在模擬hitec鹽的徑向分布函數(shù)但是423K的徑向分布函數(shù)的峰值比文獻(xiàn)上的小這要怎么辦呢？求大神么幫幫忙

可代做蛋白-小分子體系分子動(dòng)力學(xué)模擬，schrodinger分子對(duì)接等,除提供結(jié)果外，可提供對(duì)接參數(shù)設(shè)置以及優(yōu)化過程。對(duì)少于100個(gè)分子的分子對(duì)接，可提供至少兩種以上分子對(duì)接軟件（薛定諤+MOE或Autodock）的對(duì)接結(jié)果，以提高可信性。另：?jiǎn)渭冎皇歉信d趣的...

各位老師，我用lammps設(shè)置了一個(gè)區(qū)域，先在區(qū)域里塞一種原子，然后再向這個(gè)區(qū)域里塞另一種原子，這樣會(huì)不會(huì)有產(chǎn)生兩種原子坐標(biāo)重合的可能性？十分感謝

lammps新手想問大家怎么得到粗�；�的聚合物data文件？是輸入全原子的data文件，然后通過lammps的命令粗粒化，還是直接用別的軟件建模，直接輸出的就是粗�；�后的data文件？

大家好，最近在做鎂金屬對(duì)有機(jī)物的吸附，在做分子動(dòng)力學(xué)的過程中發(fā)現(xiàn)用COMPASS/COMPASSII力場(chǎng)竟然找不到Mg,只有Mg2+和MgO.但是查了官方數(shù)據(jù)后發(fā)現(xiàn)COMPASS力場(chǎng)里是有Mg金屬的。請(qǐng)問這是什么情況呀？我用的是MaterialStudio20...

實(shí)驗(yàn)室有兩臺(tái)工作站，cpu相同，均沒有g(shù)pu，只有內(nèi)存差別，一個(gè)256g，一個(gè)384g，但是我在兩臺(tái)機(jī)器上計(jì)算一樣的模型速度差別很大，內(nèi)存高的快很多，但我看計(jì)算時(shí)，內(nèi)存占用率并不高，cpu占用率都是一樣的，是什么原因呢？慢的那臺(tái)是不是安裝gromacs的時(shí)候哪...

一、Lammps基礎(chǔ)與原理MD模擬的基本邏輯思路Lammps軟件學(xué)習(xí)框架Lammps研究的幾方面重要資源二、In文件的基本邏輯框架、基本命令三、Lammps建模與進(jìn)階四、用Lammps模擬具體物理問題（應(yīng)用中存在的問題）五、用Lammps輸出研究所需要的數(shù)據(jù)信...

求discoverystudio4.5的安裝包及安裝教程