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我是胡子新蟲 (初入文壇)
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我準備在大腸桿菌中異源表達并純化Methanosarcina acetivorans中的acetate kinase (基因locus number為MA3606),請問: 1)該基因稀有密碼子含量如何?我該使用什么蛋白表達菌株? 2)選擇一種pET載體,使該異源表達的蛋白帶上C末端的His tag。 3)設計一個純化方法,將該蛋白純化(注明用什么buffer,什么色譜柱,什么流速,柱與柱之間需要進行什么處理,如何檢測蛋白等)。 |
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簡單理解一下問題就是:我該如何表達一個蛋白?樓主你沒經(jīng)驗吧,應該是沒做過,,, 沒做過的知道分析稀有密碼子含量很不錯, 1.稀有密碼子含量,你可以自己分析,你不是在大腸桿菌表達系統(tǒng)嘛,大腸桿菌有自己喜歡和不喜歡的密碼子網(wǎng)上一查就知道了(就是密碼子優(yōu)化的步驟)除此之外除了優(yōu)化密碼子還有mRNA結(jié)構(gòu)優(yōu)化,這就你自己搞了不同的公司有不同的技術(shù)(應該屬于機密了吧); 2. 你應該用什么表達菌株,一般正常情況下 BL21(DE3)就可以了,當然如有表達的蛋白有毒性或者其他特性就另說了(可以看下這篇文章,http://www.detaibio.com/topics/yuan-he-biao-da-faq.html,看原核表達FAQ那個,7 8M的打開會有點慢,里面說的挺好); 3. 你是原核表達 pet系列你都可以選擇,帶上his也很正常有利于純化嗎,親和純化哈 4. 純化方法?你都his了,當然親和純化,至于你說的什么流速什么buffer什么色譜柱,這個。。。。這都需要有蛋白純化工作經(jīng)驗至少一兩年以上的才能準確回答你,這些因素就是實驗摸索的一個過程,恰恰是最重要的,針對不同的蛋白性質(zhì)也不一樣,所以沒有固定答案,你還是好好學習親和純化原理,如何大概操作步驟,中間的試劑等等自己摸索,純化有時候buffer不對,結(jié)果都會千差萬別的,有時候還包涵體更麻煩,上清就好些了 5.檢測蛋白,檢測蛋白比較簡單,跑SDS-PAGE就可以,你的蛋白大小多大你是知道的,只需要在膠上面看看有沒有表達就行,沒有表達那就不好辦了,原因多種更要摸索,如果表達量低,可以在做Western blot定性一下,看看到底有沒有,實在不放心也可以切膠測序嗎,,,提供一些資料:祝好運,資料如下: 蛋白表達系統(tǒng)介紹:原核酵母哺乳動物系統(tǒng)/原理/操作步驟/FAQ SDS=PAGR實驗原理/操作步驟/相關(guān)FAQ Western blot實驗原理/操作步驟/相關(guān)FAQ 原核表達FAQ包括蛋白不表達,蛋白表達不在上清 蛋白純化:http://wenku.baidu.com/view/521ff9cec281e53a5902ff27 |
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蛋白表達系統(tǒng)原核/真核/酵母/哺乳動物系統(tǒng)/原理/操作步驟/FAQ:http://www.detaibio.com/topics/dan-bai-biao-da.html 蛋白不表達,蛋白表達不在上清:http://www.detaibio.com/topics/yuan-he-biao-da-faq.html SDS-PAGE實驗原理/步驟/FAQ:http://www.detaibio.com/topics/sds-page-technology.html Western blot原理實驗操作FAQ:http://www.detaibio.com/material-western-blot.html |
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