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[求助]
MS分子動力學(xué)模擬 已有1人參與
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| 用MS的discover模塊進(jìn)行分子動力學(xué)模擬,一共進(jìn)行200PS的模擬,前100ps用于平衡,后100ps用于動態(tài)分析,為什么第二階段開始時(shí)就不平衡了,是不是兩個(gè)階段需要一步完成,直接200ps? |
新蟲 (小有名氣)
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我也是新手,不知道你的分析結(jié)構(gòu)是否復(fù)雜?如果體系復(fù)雜的話200ps是不是有點(diǎn)短? 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
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專家經(jīng)驗(yàn): +1059 |

新蟲 (小有名氣)
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至尊木蟲 (職業(yè)作家)

主管區(qū)長 (職業(yè)作家)
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專家經(jīng)驗(yàn): +1059 |
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不需要兩個(gè)階段一起完成,分開也不影響。 不要人為規(guī)定計(jì)算用多少時(shí)間,如果系統(tǒng)沒平衡,再計(jì)算一段時(shí)間即可。平衡階段用時(shí)應(yīng)當(dāng)有彈性,直到平衡達(dá)到了,再進(jìn)行下一步的數(shù)據(jù)分析。 此外,建議舍棄用Discover模塊,用Forcite模塊替代,前者計(jì)算效率太低下,費(fèi)時(shí)費(fèi)力。而且不管什么模塊(Dmol3 CASTEP GULP)產(chǎn)生的MD結(jié)果文件,最終都得在Focite模塊中進(jìn)行分析。 |

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