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jackjiejl木蟲 (小有名氣)
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[求助]
VASP計算，坐標(biāo)原子固定方法|插件 已有2人參與
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通常在計算一個體系的時候，由于晶胞比較大，原子個數(shù)多，如果采用完全馳豫的話計算太耗時，并且不容易收斂，所以通常會選擇固定外圍骨架原子，只選擇反應(yīng)活性中心的部位原子可以馳豫，我一般都是把晶胞導(dǎo)出POSCAR后再根據(jù)MS里面結(jié)構(gòu)，一個一個查找需要馳豫的原子坐標(biāo)，手動固定或者馳豫，小的還好，但是遇到多一點(diǎn)原子的情況，這樣做太費(fèi)時了還容易出錯，大家通常怎么處理的？有沒有好的建議呢？ 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
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木蟲 (正式寫手)
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2樓2016-03-29 15:50:36
jackjiejl
木蟲 (小有名氣)
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比如說我要在Si-O-Al結(jié)構(gòu)的骨架中吸附個丙酮小分子C H O ，但是骨架也有很多氧原子，我只是固定部分的原子，您說的還是不行啊，沒有madeA。我在想有沒有小插件好用的呢 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2016-03-29 16:02:20
未岸亡靈
鐵桿木蟲 (著名寫手)
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5樓2016-12-08 09:26:00
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