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春華秋實(shí)2020金蟲 (正式寫手)
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[交流]
MS中建立石墨烯模型導(dǎo)入VASP中計(jì)算 已有6人參與
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最近為了在VASP中弛豫石墨烯,要在在MS中建立石墨烯模型,總結(jié)了一下步驟,僅供參考: 1、打開material studio,新建一個(gè)工程,import石墨graphite.msi,在structure/ceramic中 2、build->make p1(目的是消除對(duì)稱性,這樣才能夠刪除一層原子)。 3、刪除一層原子(選中原子->delete),并移動(dòng)剩下的原子到中間。 4、構(gòu)建supercell(方便摻雜,也為了好看):build->symetry->supercell,構(gòu)建一個(gè)6*6*1的超原胞,這樣建立的超胞模型是扶手型。 要建立鋸齒狀的,在建立supercell之前,build>symmetry>find symmetry,然后impose symmetry,此時(shí)只顯示兩個(gè)原子,然后建立supercell,6*6*1 (如果需要supercell是斜六面體,這樣就可以了,如果需要矩形,繼續(xù)下一步) 5、修改晶格參數(shù):build->crystal->rebuild crystal,設(shè)置方位角和length。由斜六面體改為矩形首先改方位角,如果只改方位角,會(huì)發(fā)現(xiàn)周期性邊界變化, 所以還要修改length,修改以后變成矩形。我的是6*6*1,a:12.78,b:12.2999 6、下面就是需要導(dǎo)出到VASP中 點(diǎn)擊castep計(jì)算energy,保存file,到相應(yīng)文件夾下找到graphite (66-cub).cell文件,此文件為隱含文件,打開,把相應(yīng)的lattice parameter和坐標(biāo)拷到POSCAR,就搞定了。 [ Last edited by 春華秋實(shí)2020 on 2013-5-15 at 17:28 ] |
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